<div class="gmail_quote"><br><div><div></div><div class="h5">Hello Sir/Madam,<br><div class="gmail_quote"><div><div><div><br></div><div>Good Afternoon. I am facing problem while doing Difficult modelling for my protein. It is showing the following error.</div>
<div>I am attaching the .aln file, my .pdb and model.py file for your reference. Hope to get a reply from you soon.</div>

<div><br></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div>Thanks &amp; Regards.</div><div><br></div><div><br></div><div><b>ERROR:</b></div><div><br></div><div>C:\Program Files\Modeller9v8\examples\ranu_basic\C4H&gt;mod9v8 model.py</div>


<div>&#39;import site&#39; failed; use -v for traceback</div><div>Traceback (most recent call last):</div><div>  File &quot;model.py&quot;, line 9, in ?</div><div>    a.make()</div><div>  File &quot;C:\Program Files\Modeller9v8\modlib\modeller\automodel\automodel.py&quot;, li</div>


<div>ne 98, in make</div><div>    self.homcsr(exit_stage)</div><div>  File &quot;C:\Program Files\Modeller9v8\modlib\modeller\automodel\automodel.py&quot;, li</div><div>ne 424, in homcsr</div><div>    self.check_alignment(aln)</div>


<div>  File &quot;C:\Program Files\Modeller9v8\modlib\modeller\automodel\automodel.py&quot;, li</div><div>ne 406, in check_alignment</div><div>    aln.check()</div><div>  File &quot;C:\Program Files\Modeller9v8\modlib\modeller\alignment.py&quot;, line 200, in</div>


<div> check</div><div>    self.check_structure_structure(io=io)</div><div>  File &quot;C:\Program Files\Modeller9v8\modlib\modeller\alignment.py&quot;, line 209, in</div><div> check_structure_structure</div><div>    return f(self.modpt, io.modpt, self.env.libs.modpt, eqvdst)</div>


<div>_modeller.ModellerError: check_a_282E&gt; Unable to read structural information for</div><div> alignment sequence:        1  2fdvA This command requires structures.</div><div><br></div><div><br></div><div><br></div>

<div>
<br></div><div><br></div><div>    </div><div>  </div></div>-- <br>Ranu Sharma<br>Msc Bioinformatics, Pune University<br>JRF, National Chemical Laboratory, Pune<br>
</div>
</div><br><br clear="all"><br>-- <br>Ranu Sharma<br>Msc Bioinformatics, Pune University<br>JRF, National Chemical Laboratory, Pune<br>
</div></div></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Ranu Sharma<br>Msc Bioinformatics, Pune University<br>JRF, National Chemical Laboratory, Pune<br>