MODELLER 7v7, Sep 12, 2004 09:15pm
PROTEIN STRUCTURE MODELLING BY SATISFACTION OF SPATIAL RESTRAINTS
Copyright(c) 1989-2004 Andrej Sali
All Rights Reserved
Written by A. Sali
with help from
B. Webb, M.S. Madhusudhan, M-Y. Shen, M.A. Marti-Renom,
N. Eswar, F. Alber, B. Oliva, A. Fiser,
R. Sanchez, B. Yerkovich, A. Badretdinov,
F. Melo, J.P. Overington, E. Feyfant
University of California, San Francisco, USA
Rockefeller University, New York, USA
Harvard University, Cambridge, USA
Imperial Cancer Research Fund, London, UK
Birkbeck College, University of London, London, UK
Kind, OS, HostName, Kernel, Processor: 4, Linux synth.compbio.ucsf.edu 2.6.8-1.521smp i686
Date and time of compilation : 09/12/2004 21:24:59
Job starting time (YY/MM/DD HH:MM:SS): 2004/09/15 17:57:44.418
Multiple dynamic programming alignment (MALIGN):
Residue-residue metric : ${MODINSTALL7v7}/modlib//as1.sim.mat
ALIGN_BLOCK : 1
Gap introduction penalty: -900.0000
Gap extension penalty : -50.0000
Length of alignment : 355
# Sequence alignment of the structurally conserved regions
# [average distance and standard deviation are with respect
# to the framework (i.e., average structure)]
#
# N av ds st dv 1bmdA 4mdhA 5mdhA 7mdhA
# =============================================
1 0.796 0.124 K 1 S 1 S 1 K 44
2 0.835 0.274 A 2 E 2 E 2 K 45
3 0.444 0.174 P 3 P 3 P 3 L 46
4 0.252 0.129 V 4 I 4 I 4 V 47
5 0.250 0.040 R 5 R 5 R 5 N 48
6 0.226 0.083 V 6 V 6 V 6 I 49
7 0.230 0.105 A 7 L 7 L 7 A 50
8 0.274 0.087 * V 8 V 8 V 8 V 51
9 0.281 0.112 T 9 T 9 T 9 S 52
10 0.451 0.052 * G 10 G 10 G 10 G 53
11 0.355 0.069 * A 11 A 11 A 11 A 54
12 0.422 0.075 * A 12 A 12 A 12 A 55
13 0.405 0.088 * G 13 G 13 G 13 G 56
14 0.460 0.209 Q 14 Q 14 Q 14 M 57
15 0.409 0.152 * I 15 I 15 I 15 I 58
16 0.302 0.101 G 16 A 16 A 16 S 59
17 0.290 0.119 Y 17 Y 17 Y 17 N 60
18 0.537 0.324 S 18 S 18 S 18 H 61
19 0.302 0.128 * L 19 L 19 L 19 L 62
20 0.293 0.104 * L 20 L 20 L 20 L 63
21 0.450 0.049 F 21 Y 21 Y 21 F 64
22 0.328 0.088 R 22 S 22 S 22 K 65
23 0.253 0.091 I 23 I 23 I 23 L 66
24 0.243 0.080 A 24 G 24 G 24 A 67
25 0.368 0.193 A 25 N 25 N 25 S 68
26 0.293 0.112 * G 26 G 26 G 26 G 69
27 0.513 0.245 E 27 S 27 S 27 E 70
28 0.393 0.224 M 28 V 28 V 28 V 71
29 0.406 0.078 L 29 F 29 F 29 F 72
30 0.482 0.155 * G 30 G 30 G 30 G 73
31 0.351 0.178 K 31 K 31 K 31 Q 74
32 0.477 0.161 * D 32 D 32 D 32 D 75
33 0.239 0.009 * Q 33 Q 33 Q 33 Q 76
34 0.315 0.120 * P 34 P 34 P 34 P 77
35 0.299 0.083 V 35 I 35 I 35 I 78
36 0.451 0.036 I 36 I 36 I 36 A 79
37 0.340 0.095 * L 37 L 37 L 37 L 80
38 0.306 0.118 Q 38 V 38 V 38 K 81
39 0.271 0.048 * L 39 L 39 L 39 L 82
40 0.230 0.075 * L 40 L 40 L 40 L 83
41 0.273 0.158 E 41 D 41 D 41 G 84
42 0.782 0.121 I 42 I 42 I 42 S 85
43 0.944 0.181 P 43 T 43 T 43 E 86
44 1.324 0.411 Q 44 P 44 P 44 R 87
45 0.874 0.157 A 45 M 45 M 45 S 88
46 0.909 0.156 M 46 M 46 M 46 F 89
47 0.861 0.075 K 47 G 47 G 47 Q 90
48 0.647 0.175 A 48 V 48 V 48 A 91
49 0.821 0.095 * L 49 L 49 L 49 L 92
50 0.828 0.104 E 50 D 50 D 50 E 93
51 0.597 0.197 * G 51 G 51 G 51 G 94
52 0.512 0.056 * V 52 V 52 V 52 V 95
53 0.778 0.110 V 53 L 53 L 53 A 96
54 0.818 0.257 * M 54 M 54 M 54 M 97
55 0.555 0.177 * E 55 E 55 E 55 E 98
56 0.573 0.168 * L 56 L 56 L 56 L 99
57 1.044 0.218 E 57 Q 57 Q 57 E 100
58 1.058 0.231 * D 58 D 58 D 58 D 101
59 0.908 0.288 C 59 C 59 C 59 S 102
60 1.283 0.259 A 60 A 60 A 60 L 103
61 0.417 0.028 F 61 L 61 L 61 Y 104
62 0.497 0.157 * P 62 P 62 P 62 P 105
63 0.236 0.078 * L 63 L 63 L 63 L 106
64 0.243 0.080 * L 64 L 64 L 64 L 107
65 0.355 0.151 A 65 K 65 K 65 R 108
66 0.436 0.059 G 66 D 66 D 66 E 109
67 0.328 0.043 L 67 V 67 V 67 V 110
68 0.233 0.106 E 68 I 68 I 68 S 111
69 0.426 0.189 A 69 A 69 A 69 I 112
70 0.451 0.210 T 70 T 70 T 70 G 113
71 0.600 0.250 D 71 D 71 D 71 I 114
72 0.967 0.377 D 72 K 72 K 72 D 115
73 1.123 0.238 P 73 E 73 E 73 P 116
74 1.322 0.239 D 74 E 74 E 74 Y 117
75 0.794 0.304 V 75 I 75 I 75 E 118
76 0.436 0.123 A 76 A 76 A 76 V 119
77 0.523 0.127 * F 77 F 77 F 77 F 120
78 0.322 0.192 K 78 K 78 K 78 E 121
79 0.298 0.064 * D 79 D 79 D 79 D 122
80 0.357 0.122 A 80 L 80 L 80 V 123
81 0.253 0.103 * D 81 D 81 D 81 D 124
82 0.284 0.100 Y 82 V 82 V 82 W 125
83 0.298 0.108 * A 83 A 83 A 83 A 126
84 0.245 0.124 L 84 I 84 I 84 L 127
85 0.204 0.061 * L 85 L 85 L 85 L 128
86 0.255 0.041 V 86 V 86 V 86 I 129
87 0.488 0.105 * G 87 G 87 G 87 G 130
88 0.598 0.160 A 88 S 88 S 88 A 131
# =============================================
89 1.082 0.389 P 90 M 89 M 89 K 132
# =============================================
90 1.433 0.483 R 97 L 100 D 99 R 140
# =============================================
91 1.328 0.424 * L 100 L 101 L 100 L 143
# =============================================
92 1.153 0.189 V 103 A 103 A 103 I 146
93 0.540 0.178 * N 104 N 104 N 104 N 147
94 0.863 0.384 G 105 V 105 V 105 G 148
95 0.659 0.300 K 106 K 106 K 106 Q 149
96 0.321 0.062 * I 107 I 107 I 107 I 150
97 0.273 0.078 * F 108 F 108 F 108 F 151
98 0.362 0.195 T 109 K 109 K 109 A 152
99 0.313 0.172 E 110 C 110 C 110 D 153
100 0.172 0.041 * Q 111 Q 111 Q 111 Q 154
101 0.258 0.106 * G 112 G 112 G 112 G 155
102 0.316 0.154 R 113 A 113 A 113 K 156
103 0.280 0.076 * A 114 A 114 A 114 A 157
104 0.247 0.085 * L 115 L 115 L 115 L 158
105 0.273 0.109 A 116 D 116 D 116 N 159
106 0.260 0.096 E 117 K 117 K 117 A 160
107 0.221 0.097 V 118 Y 118 Y 118 V 161
108 0.283 0.044 * A 119 A 119 A 119 A 162
109 0.412 0.043 K 120 K 120 K 120 S 163
110 0.257 0.034 * K 121 K 121 K 121 K 164
111 0.430 0.065 D 122 S 122 S 122 N 165
112 0.242 0.113 * V 123 V 123 V 123 V 166
113 0.290 0.114 * K 124 K 124 K 124 K 167
114 0.359 0.125 * V 125 V 125 V 125 V 168
115 0.309 0.109 L 126 I 126 I 126 L 169
116 0.346 0.101 * V 127 V 127 V 127 V 170
117 0.383 0.074 * V 128 V 128 V 128 V 171
118 0.363 0.134 * G 129 G 129 G 129 G 172
119 0.389 0.084 * N 130 N 130 N 130 N 173
120 0.372 0.078 * P 131 P 131 P 131 P 174
121 0.323 0.072 A 132 A 132 A 132 C 175
122 0.270 0.141 * N 133 N 133 N 133 N 176
123 0.265 0.125 * T 134 T 134 T 134 T 177
124 0.195 0.101 * N 135 N 135 N 135 N 178
125 0.174 0.018 A 136 C 136 C 136 A 179
126 0.267 0.146 * L 137 L 137 L 137 L 180
127 0.284 0.134 I 138 T 138 T 138 I 181
128 0.176 0.071 A 139 A 139 A 139 C 182
129 0.244 0.055 Y 140 S 140 S 140 L 183
130 0.320 0.157 * K 141 K 141 K 141 K 184
131 0.358 0.218 N 142 S 142 S 142 N 185
132 0.382 0.222 * A 143 A 143 A 143 A 186
133 0.752 0.393 * P 144 P 144 P 144 P 187
134 0.314 0.175 G 145 S 145 S 145 D 188
135 0.256 0.082 L 146 I 146 I 146 I 189
136 0.327 0.033 N 147 P 147 P 147 P 190
137 0.442 0.120 P 148 K 148 K 148 A 191
138 0.500 0.294 R 149 E 149 E 149 K 192
139 0.429 0.123 * N 150 N 150 N 150 N 193
140 0.430 0.111 * F 151 F 151 F 151 F 194
141 0.455 0.144 T 152 S 152 S 152 H 195
142 0.471 0.187 A 153 C 153 C 153 A 196
143 0.182 0.106 M 154 L 154 L 154 L 197
144 0.346 0.093 * T 155 T 155 T 155 T 198
145 0.205 0.056 * R 156 R 156 R 156 R 199
146 0.342 0.074 * L 157 L 157 L 157 L 200
147 0.444 0.087 * D 158 D 158 D 158 D 201
148 0.320 0.056 H 159 H 159 H 159 E 202
149 0.365 0.032 * N 160 N 160 N 160 N 203
150 0.609 0.115 * R 161 R 161 R 161 R 204
151 0.399 0.070 * A 162 A 162 A 162 A 205
152 0.323 0.128 * K 163 K 163 K 163 K 206
153 0.589 0.123 A 164 A 164 A 164 C 207
154 0.555 0.204 * Q 165 Q 165 Q 165 Q 208
155 0.408 0.105 L 166 I 166 I 166 L 209
156 0.696 0.167 * A 167 A 167 A 167 A 210
157 0.838 0.136 K 168 L 168 L 168 L 211
158 0.664 0.129 * K 169 K 169 K 169 K 212
159 0.788 0.115 T 170 L 170 L 170 A 213
160 1.041 0.123 * G 171 G 171 G 171 G 214
161 0.867 0.150 T 172 V 172 V 172 V 215
162 0.888 0.241 G 173 T 173 T 173 F 216
163 0.792 0.187 V 174 S 174 S 174 Y 217
164 0.693 0.198 * D 175 D 175 D 175 D 218
165 0.738 0.350 R 176 D 176 D 176 K 219
166 0.570 0.314 I 177 V 177 V 177 V 220
167 0.569 0.282 R 178 K 178 K 178 S 221
168 0.343 0.231 R 179 N 179 N 179 N 222
169 0.577 0.175 M 180 V 180 V 180 V 223
170 0.488 0.079 T 181 I 181 I 181 T 224
171 0.419 0.125 V 182 I 182 I 182 I 225
172 0.357 0.104 * W 183 W 183 W 183 W 226
173 0.409 0.093 * G 184 G 184 G 184 G 227
174 0.350 0.117 * N 185 N 185 N 185 N 228
175 0.336 0.052 * H 186 H 186 H 186 H 229
176 0.400 0.124 * S 187 S 187 S 187 S 230
177 0.320 0.057 S 188 S 188 S 188 T 231
178 0.335 0.159 * T 189 T 189 T 189 T 232
179 0.435 0.150 M 190 Q 190 Q 190 Q 233
180 0.382 0.112 F 191 Y 191 Y 191 V 234
181 0.340 0.178 * P 192 P 192 P 192 P 235
182 0.411 0.189 * D 193 D 193 D 193 D 236
183 0.598 0.154 L 194 V 194 V 194 F 237
184 0.451 0.187 F 195 N 195 N 195 L 238
185 0.554 0.340 H 196 H 196 H 196 N 239
186 0.559 0.362 * A 197 A 197 A 197 A 240
187 0.518 0.270 E 198 K 198 K 198 K 241
188 0.387 0.149 V 199 V 199 V 199 I 242
189 0.932 0.257 D 200 K 200 K 200 D 243
# =============================================
190 1.445 0.548 G 205 E 205 E 205 G 244
191 1.015 0.374 R 206 V 206 V 206 R 245
192 0.763 0.145 P 207 G 207 G 207 P 246
193 0.580 0.023 A 208 V 208 V 208 V 247
194 0.670 0.118 L 209 Y 209 Y 209 K 248
195 0.737 0.278 * E 210 E 210 E 210 E 249
196 0.507 0.223 L 211 A 211 A 211 V 250
197 0.641 0.199 V 212 V 212 V 212 I 251
# =============================================
198 0.988 0.482 D 214 D 214 D 214 R 253
199 0.577 0.371 M 215 D 215 D 215 T 254
200 0.778 0.081 E 216 S 216 S 216 K 255
201 0.683 0.337 * W 217 W 217 W 217 W 256
202 0.409 0.053 Y 218 L 218 L 218 L 257
203 0.865 0.302 E 219 K 219 K 219 E 258
204 1.016 0.567 K 220 G 220 G 220 E 259
205 0.971 0.395 V 221 E 221 E 221 E 260
206 0.626 0.150 * F 222 F 222 F 222 F 261
207 0.675 0.088 I 223 I 223 I 223 T 262
208 0.858 0.081 P 224 T 224 T 224 I 263
209 0.983 0.136 * T 225 T 225 T 225 T 264
210 0.843 0.023 * V 226 V 226 V 226 V 265
211 1.111 0.117 A 227 Q 227 Q 227 Q 266
212 1.493 0.222 Q 228 Q 228 Q 228 K 267
213 1.400 0.240 * R 229 R 229 R 229 R 268
214 1.554 0.312 * G 230 G 230 G 230 G 269
# =============================================
215 0.495 0.178 A 231 A 232 A 232 G 270
# =============================================
216 1.637 0.213 I 234 V 233 V 233 I 273
# =============================================
217 1.042 0.313 Q 235 A 236 A 236 Q 274
# =============================================
218 1.249 0.313 G 238 R 237 R 237 G 277
# =============================================
219 1.844 0.225 A 239 L 239 L 239 R 278
220 1.723 0.275 * S 240 S 240 S 240 S 279
221 1.456 0.406 * S 241 S 241 S 241 S 280
222 0.606 0.235 * A 242 A 242 A 242 A 281
223 0.589 0.223 A 243 M 243 M 243 A 282
224 0.709 0.246 * S 244 S 244 S 244 S 283
225 0.527 0.269 A 245 A 245 A 245 T 284
226 0.349 0.193 * A 246 A 246 A 246 A 285
227 0.363 0.128 N 247 K 247 K 247 V 286
228 0.314 0.159 A 248 A 248 A 248 S 287
229 0.308 0.155 A 249 I 249 I 249 I 288
230 0.264 0.136 I 250 C 250 C 250 A 289
231 0.267 0.117 E 251 D 251 D 251 D 290
232 0.212 0.109 H 252 H 252 H 252 A 291
233 0.301 0.179 I 253 V 253 V 253 I 292
234 0.372 0.217 R 254 R 254 R 254 K 293
235 0.384 0.160 D 255 D 255 D 255 S 294
236 0.448 0.101 W 256 I 256 I 256 L 295
237 0.726 0.282 A 257 W 257 W 257 V 296
238 0.707 0.388 L 258 F 258 F 258 T 297
239 1.054 0.568 G 259 G 259 G 259 P 298
240 0.646 0.336 * T 260 T 260 T 260 T 299
241 0.663 0.336 * P 261 P 261 P 261 P 300
242 0.780 0.388 * E 262 E 262 E 262 E 301
243 0.742 0.443 * G 263 G 263 G 263 G 302
244 0.498 0.171 D 264 E 264 E 264 D 303
245 0.341 0.149 W 265 F 265 F 265 W 304
246 0.325 0.076 V 266 V 266 V 266 F 305
247 0.249 0.052 * S 267 S 267 S 267 S 306
248 0.352 0.127 M 268 M 268 M 268 T 307
249 0.350 0.137 A 269 G 269 G 269 G 308
250 0.319 0.167 V 270 I 270 I 270 V 309
251 0.331 0.105 P 271 I 271 I 271 Y 310
252 0.268 0.028 S 272 S 272 S 272 T 311
253 0.612 0.396 Q 273 D 273 D 273 T 312
254 1.563 0.926 * G 274 G 274 G 274 G 313
255 0.770 0.395 E 275 N 275 N 275 N 314
# =============================================
256 0.492 0.172 * Y 277 Y 277 Y 277 Y 316
257 0.797 0.153 * G 278 G 278 G 278 G 317
258 0.347 0.162 I 279 V 279 V 279 I 318
259 0.451 0.061 P 280 P 280 P 280 A 319
260 0.429 0.063 E 281 D 281 D 281 E 320
261 0.563 0.252 G 282 D 282 D 282 D 321
262 0.617 0.169 I 283 L 283 L 283 I 322
263 0.301 0.151 V 284 L 284 L 284 V 323
264 0.270 0.091 Y 285 Y 285 Y 285 F 324
265 0.340 0.097 * S 286 S 286 S 286 S 325
266 0.315 0.123 F 287 F 287 F 287 M 326
267 0.313 0.086 * P 288 P 288 P 288 P 327
268 0.341 0.081 V 289 V 289 V 289 C 328
269 0.359 0.034 T 290 T 290 T 290 R 329
270 0.329 0.131 A 291 I 291 I 291 S 330
271 0.675 0.097 * K 292 K 292 K 292 K 331
# =============================================
272 1.173 0.169 * D 293 D 293 D 293 D 333
273 0.865 0.375 G 294 K 294 K 294 G 334
274 0.857 0.422 A 295 T 295 T 295 D 335
275 0.459 0.081 Y 296 W 296 W 296 Y 336
276 0.394 0.171 R 297 K 297 K 297 E 337
277 0.359 0.090 V 298 I 298 I 298 L 338
278 0.364 0.153 V 299 V 299 V 299 A 339
279 0.622 0.245 E 300 E 300 E 300 T 340
# =============================================
280 0.823 0.389 L 302 L 302 L 302 V 342
281 0.853 0.420 E 303 P 303 P 303 S 343
282 0.440 0.156 I 304 I 304 I 304 N 344
283 0.444 0.069 N 305 N 305 N 305 D 345
284 0.521 0.073 E 306 D 306 D 306 D 346
285 0.482 0.183 * F 307 F 307 F 307 F 347
286 0.460 0.085 A 308 S 308 S 308 L 348
287 0.567 0.174 R 309 R 309 R 309 W 349
288 0.287 0.082 K 310 E 310 E 310 E 350
289 0.399 0.081 R 311 K 311 K 311 R 351
290 0.397 0.120 M 312 M 312 M 312 I 352
291 0.431 0.115 E 313 D 313 D 313 K 353
292 0.378 0.124 I 314 L 314 L 314 K 354
293 0.400 0.101 T 315 T 315 T 315 S 355
294 0.460 0.150 A 316 A 316 A 316 E 356
295 0.436 0.100 Q 317 K 317 K 317 A 357
296 0.358 0.108 * E 318 E 318 E 318 E 358
297 0.292 0.087 * L 319 L 319 L 319 L 359
298 0.383 0.163 L 320 A 320 A 320 L 360
299 0.395 0.172 D 321 E 321 E 321 A 361
300 0.306 0.069 * E 322 E 322 E 322 E 362
301 0.243 0.110 M 323 K 323 K 323 K 363
302 0.544 0.196 E 324 E 324 E 324 K 364
303 0.523 0.158 Q 325 T 325 T 325 C 365
304 0.778 0.087 V 326 A 326 A 326 V 366
305 0.965 0.265 K 327 F 327 F 327 A 367
# =============================================
306 1.263 0.265 G 330 S 331 S 331 H 368
# =============================================
# Sequence alignment of the structurally conserved regions
# [average distance and standard deviation are with respect
# to the framework (i.e., average structure)]
#
# N av ds st dv 1bmdA 4mdhA 5mdhA 7mdhA
# =============================================
1 0.836 0.118 K 1 S 1 S 1 K 44
2 0.851 0.279 A 2 E 2 E 2 K 45
3 0.482 0.141 P 3 P 3 P 3 L 46
4 0.338 0.159 V 4 I 4 I 4 V 47
5 0.312 0.069 R 5 R 5 R 5 N 48
6 0.171 0.076 V 6 V 6 V 6 I 49
7 0.232 0.086 A 7 L 7 L 7 A 50
8 0.289 0.049 * V 8 V 8 V 8 V 51
9 0.176 0.103 T 9 T 9 T 9 S 52
10 0.319 0.109 * G 10 G 10 G 10 G 53
11 0.283 0.024 * A 11 A 11 A 11 A 54
12 0.340 0.010 * A 12 A 12 A 12 A 55
13 0.307 0.134 * G 13 G 13 G 13 G 56
14 0.343 0.211 Q 14 Q 14 Q 14 M 57
15 0.316 0.169 * I 15 I 15 I 15 I 58
16 0.259 0.107 G 16 A 16 A 16 S 59
17 0.233 0.142 Y 17 Y 17 Y 17 N 60
18 0.497 0.314 S 18 S 18 S 18 H 61
19 0.335 0.104 * L 19 L 19 L 19 L 62
20 0.320 0.093 * L 20 L 20 L 20 L 63
21 0.443 0.037 F 21 Y 21 Y 21 F 64
22 0.285 0.098 R 22 S 22 S 22 K 65
23 0.247 0.077 I 23 I 23 I 23 L 66
24 0.216 0.074 A 24 G 24 G 24 A 67
25 0.344 0.152 A 25 N 25 N 25 S 68
26 0.304 0.111 * G 26 G 26 G 26 G 69
27 0.553 0.263 E 27 S 27 S 27 E 70
28 0.439 0.238 M 28 V 28 V 28 V 71
29 0.476 0.086 L 29 F 29 F 29 F 72
30 0.580 0.149 * G 30 G 30 G 30 G 73
31 0.361 0.169 K 31 K 31 K 31 Q 74
32 0.521 0.180 * D 32 D 32 D 32 D 75
33 0.305 0.036 * Q 33 Q 33 Q 33 Q 76
34 0.419 0.093 * P 34 P 34 P 34 P 77
35 0.369 0.059 V 35 I 35 I 35 I 78
36 0.466 0.045 I 36 I 36 I 36 A 79
37 0.259 0.079 * L 37 L 37 L 37 L 80
38 0.285 0.045 Q 38 V 38 V 38 K 81
39 0.246 0.079 * L 39 L 39 L 39 L 82
40 0.202 0.038 * L 40 L 40 L 40 L 83
41 0.237 0.071 E 41 D 41 D 41 G 84
42 0.664 0.116 I 42 I 42 I 42 S 85
43 0.770 0.184 P 43 T 43 T 43 E 86
44 1.175 0.449 Q 44 P 44 P 44 R 87
45 0.736 0.150 A 45 M 45 M 45 S 88
46 0.783 0.170 M 46 M 46 M 46 F 89
47 0.768 0.088 K 47 G 47 G 47 Q 90
48 0.590 0.206 A 48 V 48 V 48 A 91
49 0.758 0.132 * L 49 L 49 L 49 L 92
50 0.780 0.118 E 50 D 50 D 50 E 93
51 0.590 0.204 * G 51 G 51 G 51 G 94
52 0.508 0.074 * V 52 V 52 V 52 V 95
53 0.756 0.112 V 53 L 53 L 53 A 96
54 0.816 0.230 * M 54 M 54 M 54 M 97
55 0.569 0.146 * E 55 E 55 E 55 E 98
56 0.556 0.135 * L 56 L 56 L 56 L 99
57 0.999 0.188 E 57 Q 57 Q 57 E 100
58 1.024 0.195 * D 58 D 58 D 58 D 101
59 0.854 0.262 C 59 C 59 C 59 S 102
60 1.190 0.245 A 60 A 60 A 60 L 103
61 0.359 0.039 F 61 L 61 L 61 Y 104
62 0.540 0.197 * P 62 P 62 P 62 P 105
63 0.299 0.085 * L 63 L 63 L 63 L 106
64 0.330 0.086 * L 64 L 64 L 64 L 107
65 0.424 0.159 A 65 K 65 K 65 R 108
66 0.484 0.053 G 66 D 66 D 66 E 109
67 0.366 0.063 L 67 V 67 V 67 V 110
68 0.190 0.076 E 68 I 68 I 68 S 111
69 0.406 0.185 A 69 A 69 A 69 I 112
70 0.381 0.148 T 70 T 70 T 70 G 113
71 0.482 0.232 D 71 D 71 D 71 I 114
72 0.838 0.360 D 72 K 72 K 72 D 115
73 1.008 0.226 P 73 E 73 E 73 P 116
74 1.198 0.210 D 74 E 74 E 74 Y 117
75 0.658 0.288 V 75 I 75 I 75 E 118
76 0.416 0.126 A 76 A 76 A 76 V 119
77 0.544 0.108 * F 77 F 77 F 77 F 120
78 0.369 0.165 K 78 K 78 K 78 E 121
79 0.356 0.070 * D 79 D 79 D 79 D 122
80 0.312 0.109 A 80 L 80 L 80 V 123
81 0.185 0.053 * D 81 D 81 D 81 D 124
82 0.216 0.042 Y 82 V 82 V 82 W 125
83 0.209 0.049 * A 83 A 83 A 83 A 126
84 0.167 0.075 L 84 I 84 I 84 L 127
85 0.126 0.040 * L 85 L 85 L 85 L 128
86 0.163 0.054 V 86 V 86 V 86 I 129
87 0.349 0.027 * G 87 G 87 G 87 G 130
88 0.610 0.174 A 88 S 88 S 88 A 131
# =============================================
89 1.383 0.320 P 90 M 89 M 89 P 133
# =============================================
90 1.481 0.649 R 97 L 100 D 99 R 140
# =============================================
91 1.160 0.416 L 101 K 102 K 102 L 144
# =============================================
92 1.456 0.284 V 103 A 103 A 103 I 146
93 0.776 0.235 * N 104 N 104 N 104 N 147
94 1.083 0.431 G 105 V 105 V 105 G 148
95 0.840 0.344 K 106 K 106 K 106 Q 149
96 0.407 0.072 * I 107 I 107 I 107 I 150
97 0.380 0.101 * F 108 F 108 F 108 F 151
98 0.536 0.252 T 109 K 109 K 109 A 152
99 0.472 0.221 E 110 C 110 C 110 D 153
100 0.211 0.024 * Q 111 Q 111 Q 111 Q 154
101 0.183 0.091 * G 112 G 112 G 112 G 155
102 0.355 0.105 R 113 A 113 A 113 K 156
103 0.348 0.103 * A 114 A 114 A 114 A 157
104 0.249 0.041 * L 115 L 115 L 115 L 158
105 0.348 0.082 A 116 D 116 D 116 N 159
106 0.358 0.110 E 117 K 117 K 117 A 160
107 0.363 0.093 V 118 Y 118 Y 118 V 161
108 0.250 0.084 * A 119 A 119 A 119 A 162
109 0.418 0.073 K 120 K 120 K 120 S 163
110 0.360 0.073 * K 121 K 121 K 121 K 164
111 0.369 0.041 D 122 S 122 S 122 N 165
112 0.194 0.063 * V 123 V 123 V 123 V 166
113 0.236 0.082 * K 124 K 124 K 124 K 167
114 0.265 0.091 * V 125 V 125 V 125 V 168
115 0.224 0.083 L 126 I 126 I 126 L 169
116 0.234 0.071 * V 127 V 127 V 127 V 170
117 0.272 0.050 * V 128 V 128 V 128 V 171
118 0.287 0.064 * G 129 G 129 G 129 G 172
119 0.353 0.071 * N 130 N 130 N 130 N 173
120 0.406 0.068 * P 131 P 131 P 131 P 174
121 0.381 0.145 A 132 A 132 A 132 C 175
122 0.262 0.061 * N 133 N 133 N 133 N 176
123 0.259 0.034 * T 134 T 134 T 134 T 177
124 0.212 0.066 * N 135 N 135 N 135 N 178
125 0.217 0.079 A 136 C 136 C 136 A 179
126 0.262 0.141 * L 137 L 137 L 137 L 180
127 0.307 0.098 I 138 T 138 T 138 I 181
128 0.156 0.068 A 139 A 139 A 139 C 182
129 0.212 0.110 Y 140 S 140 S 140 L 183
130 0.221 0.090 * K 141 K 141 K 141 K 184
131 0.225 0.096 N 142 S 142 S 142 N 185
132 0.318 0.156 * A 143 A 143 A 143 A 186
133 0.756 0.417 * P 144 P 144 P 144 P 187
134 0.246 0.174 G 145 S 145 S 145 D 188
135 0.232 0.109 L 146 I 146 I 146 I 189
136 0.248 0.067 N 147 P 147 P 147 P 190
137 0.341 0.196 P 148 K 148 K 148 A 191
138 0.444 0.260 R 149 E 149 E 149 K 192
139 0.359 0.112 * N 150 N 150 N 150 N 193
140 0.374 0.090 * F 151 F 151 F 151 F 194
141 0.432 0.096 T 152 S 152 S 152 H 195
142 0.402 0.206 A 153 C 153 C 153 A 196
143 0.115 0.049 M 154 L 154 L 154 L 197
144 0.261 0.123 * T 155 T 155 T 155 T 198
145 0.150 0.074 * R 156 R 156 R 156 R 199
146 0.226 0.108 * L 157 L 157 L 157 L 200
147 0.310 0.127 * D 158 D 158 D 158 D 201
148 0.213 0.111 H 159 H 159 H 159 E 202
149 0.223 0.066 * N 160 N 160 N 160 N 203
150 0.408 0.142 * R 161 R 161 R 161 R 204
151 0.228 0.039 * A 162 A 162 A 162 A 205
152 0.145 0.053 * K 163 K 163 K 163 K 206
153 0.378 0.074 A 164 A 164 A 164 C 207
154 0.300 0.116 * Q 165 Q 165 Q 165 Q 208
155 0.278 0.116 L 166 I 166 I 166 L 209
156 0.551 0.156 * A 167 A 167 A 167 A 210
157 0.641 0.146 K 168 L 168 L 168 L 211
158 0.511 0.168 * K 169 K 169 K 169 K 212
159 0.693 0.226 T 170 L 170 L 170 A 213
160 0.919 0.244 * G 171 G 171 G 171 G 214
161 0.774 0.072 T 172 V 172 V 172 V 215
162 0.782 0.136 G 173 T 173 T 173 F 216
163 0.676 0.086 V 174 S 174 S 174 Y 217
164 0.569 0.122 * D 175 D 175 D 175 D 218
165 0.587 0.256 R 176 D 176 D 176 K 219
166 0.401 0.214 I 177 V 177 V 177 V 220
167 0.463 0.205 R 178 K 178 K 178 S 221
168 0.297 0.086 R 179 N 179 N 179 N 222
169 0.447 0.138 M 180 V 180 V 180 V 223
170 0.368 0.106 T 181 I 181 I 181 T 224
171 0.288 0.121 V 182 I 182 I 182 I 225
172 0.267 0.077 * W 183 W 183 W 183 W 226
173 0.324 0.031 * G 184 G 184 G 184 G 227
174 0.320 0.082 * N 185 N 185 N 185 N 228
175 0.294 0.076 * H 186 H 186 H 186 H 229
176 0.361 0.140 * S 187 S 187 S 187 S 230
177 0.264 0.125 S 188 S 188 S 188 T 231
178 0.237 0.131 * T 189 T 189 T 189 T 232
179 0.306 0.126 M 190 Q 190 Q 190 Q 233
180 0.286 0.096 F 191 Y 191 Y 191 V 234
181 0.237 0.042 * P 192 P 192 P 192 P 235
182 0.263 0.111 * D 193 D 193 D 193 D 236
183 0.592 0.194 L 194 V 194 V 194 F 237
184 0.470 0.275 F 195 N 195 N 195 L 238
185 0.593 0.355 H 196 H 196 H 196 N 239
186 0.612 0.364 * A 197 A 197 A 197 A 240
187 0.551 0.291 E 198 K 198 K 198 K 241
188 0.361 0.168 V 199 V 199 V 199 I 242
189 0.814 0.319 D 200 K 200 K 200 D 243
# =============================================
190 1.332 0.591 G 205 E 205 E 205 G 244
191 0.817 0.459 R 206 V 206 V 206 R 245
192 0.628 0.225 P 207 G 207 G 207 P 246
193 0.445 0.095 A 208 V 208 V 208 V 247
194 0.487 0.191 L 209 Y 209 Y 209 K 248
195 0.548 0.264 * E 210 E 210 E 210 E 249
196 0.623 0.267 L 211 A 211 A 211 V 250
197 0.773 0.324 V 212 V 212 V 212 I 251
# =============================================
198 0.877 0.536 D 214 D 214 D 214 R 253
199 0.636 0.397 M 215 D 215 D 215 T 254
200 0.487 0.187 E 216 S 216 S 216 K 255
201 0.370 0.229 * W 217 W 217 W 217 W 256
202 0.358 0.127 Y 218 L 218 L 218 L 257
203 0.853 0.368 E 219 K 219 K 219 E 258
204 0.920 0.481 K 220 G 220 G 220 E 259
205 0.694 0.254 V 221 E 221 E 221 E 260
206 0.419 0.036 * F 222 F 222 F 222 F 261
207 0.512 0.139 I 223 I 223 I 223 T 262
208 0.603 0.112 P 224 T 224 T 224 I 263
209 0.704 0.148 * T 225 T 225 T 225 T 264
210 0.629 0.072 * V 226 V 226 V 226 V 265
211 0.926 0.181 A 227 Q 227 Q 227 Q 266
212 1.240 0.279 Q 228 Q 228 Q 228 K 267
213 1.155 0.301 * R 229 R 229 R 229 R 268
214 1.343 0.363 * G 230 G 230 G 230 G 269
# =============================================
215 0.547 0.183 A 231 A 232 A 232 G 270
# =============================================
216 1.538 0.318 I 233 V 233 V 233 L 272
217 1.814 0.435 * I 234 I 234 I 234 I 273
# =============================================
218 0.891 0.278 Q 235 A 236 A 236 Q 274
# =============================================
219 1.187 0.265 G 238 R 237 R 237 G 277
# =============================================
220 1.616 0.262 A 239 L 239 L 239 R 278
221 1.533 0.335 * S 240 S 240 S 240 S 279
222 1.269 0.445 * S 241 S 241 S 241 S 280
223 0.486 0.263 * A 242 A 242 A 242 A 281
224 0.533 0.191 A 243 M 243 M 243 A 282
225 0.596 0.246 * S 244 S 244 S 244 S 283
226 0.435 0.259 A 245 A 245 A 245 T 284
227 0.338 0.159 * A 246 A 246 A 246 A 285
228 0.341 0.135 N 247 K 247 K 247 V 286
229 0.302 0.155 A 248 A 248 A 248 S 287
230 0.326 0.159 A 249 I 249 I 249 I 288
231 0.300 0.171 I 250 C 250 C 250 A 289
232 0.278 0.140 E 251 D 251 D 251 D 290
233 0.251 0.112 H 252 H 252 H 252 A 291
234 0.345 0.204 I 253 V 253 V 253 I 292
235 0.416 0.248 R 254 R 254 R 254 K 293
236 0.395 0.188 D 255 D 255 D 255 S 294
237 0.485 0.097 W 256 I 256 I 256 L 295
238 0.777 0.315 A 257 W 257 W 257 V 296
239 0.757 0.417 L 258 F 258 F 258 T 297
240 1.078 0.590 G 259 G 259 G 259 P 298
241 0.638 0.363 * T 260 T 260 T 260 T 299
242 0.724 0.338 * P 261 P 261 P 261 P 300
243 0.812 0.372 * E 262 E 262 E 262 E 301
244 0.731 0.412 * G 263 G 263 G 263 G 302
245 0.479 0.191 D 264 E 264 E 264 D 303
246 0.262 0.093 W 265 F 265 F 265 W 304
247 0.238 0.084 V 266 V 266 V 266 F 305
248 0.166 0.038 * S 267 S 267 S 267 S 306
249 0.300 0.149 M 268 M 268 M 268 T 307
250 0.252 0.134 A 269 G 269 G 269 G 308
251 0.254 0.143 V 270 I 270 I 270 V 309
252 0.340 0.105 P 271 I 271 I 271 Y 310
253 0.360 0.039 S 272 S 272 S 272 T 311
254 0.550 0.333 Q 273 D 273 D 273 T 312
255 1.533 0.953 * G 274 G 274 G 274 G 313
256 0.746 0.372 E 275 N 275 N 275 N 314
# =============================================
257 0.572 0.110 * Y 277 Y 277 Y 277 Y 316
258 0.919 0.088 * G 278 G 278 G 278 G 317
259 0.410 0.152 I 279 V 279 V 279 I 318
260 0.471 0.110 P 280 P 280 P 280 A 319
261 0.456 0.146 E 281 D 281 D 281 E 320
262 0.585 0.197 G 282 D 282 D 282 D 321
263 0.641 0.167 I 283 L 283 L 283 I 322
264 0.265 0.062 V 284 L 284 L 284 V 323
265 0.155 0.074 Y 285 Y 285 Y 285 F 324
266 0.229 0.078 * S 286 S 286 S 286 S 325
267 0.231 0.098 F 287 F 287 F 287 M 326
268 0.231 0.081 * P 288 P 288 P 288 P 327
269 0.289 0.088 V 289 V 289 V 289 C 328
270 0.309 0.059 T 290 T 290 T 290 R 329
271 0.318 0.133 A 291 I 291 I 291 S 330
272 0.690 0.149 * K 292 K 292 K 292 K 331
# =============================================
273 1.137 0.142 * D 293 D 293 D 293 D 333
274 0.824 0.351 G 294 K 294 K 294 G 334
275 0.818 0.404 A 295 T 295 T 295 D 335
276 0.426 0.094 Y 296 W 296 W 296 Y 336
277 0.332 0.181 R 297 K 297 K 297 E 337
278 0.343 0.082 V 298 I 298 I 298 L 338
279 0.378 0.099 V 299 V 299 V 299 A 339
280 0.664 0.297 E 300 E 300 E 300 T 340
# =============================================
281 0.787 0.393 L 302 L 302 L 302 V 342
282 0.817 0.395 E 303 P 303 P 303 S 343
283 0.405 0.097 I 304 I 304 I 304 N 344
284 0.396 0.150 N 305 N 305 N 305 D 345
285 0.409 0.197 E 306 D 306 D 306 D 346
286 0.270 0.062 * F 307 F 307 F 307 F 347
287 0.328 0.133 A 308 S 308 S 308 L 348
288 0.451 0.275 R 309 R 309 R 309 W 349
289 0.200 0.126 K 310 E 310 E 310 E 350
290 0.270 0.117 R 311 K 311 K 311 R 351
291 0.303 0.161 M 312 M 312 M 312 I 352
292 0.308 0.125 E 313 D 313 D 313 K 353
293 0.311 0.140 I 314 L 314 L 314 K 354
294 0.299 0.105 T 315 T 315 T 315 S 355
295 0.276 0.138 A 316 A 316 A 316 E 356
296 0.310 0.077 Q 317 K 317 K 317 A 357
297 0.306 0.104 * E 318 E 318 E 318 E 358
298 0.251 0.141 * L 319 L 319 L 319 L 359
299 0.323 0.082 L 320 A 320 A 320 L 360
300 0.471 0.092 D 321 E 321 E 321 A 361
301 0.416 0.093 * E 322 E 322 E 322 E 362
302 0.333 0.119 M 323 K 323 K 323 K 363
303 0.599 0.188 E 324 E 324 E 324 K 364
304 0.655 0.199 Q 325 T 325 T 325 C 365
305 0.929 0.142 V 326 A 326 A 326 V 366
306 1.032 0.252 K 327 F 327 F 327 A 367
# =============================================
307 1.163 0.419 G 330 S 331 S 331 H 368
# =============================================
# Sequence alignment of the structurally conserved regions
# [average distance and standard deviation are with respect
# to the framework (i.e., average structure)]
#
# N av ds st dv 1bmdA 4mdhA 5mdhA 7mdhA
# =============================================
1 0.840 0.119 K 1 S 1 S 1 K 44
2 0.852 0.277 A 2 E 2 E 2 K 45
3 0.483 0.142 P 3 P 3 P 3 L 46
4 0.338 0.159 V 4 I 4 I 4 V 47
5 0.310 0.070 R 5 R 5 R 5 N 48
6 0.166 0.076 V 6 V 6 V 6 I 49
7 0.241 0.087 A 7 L 7 L 7 A 50
8 0.302 0.057 * V 8 V 8 V 8 V 51
9 0.180 0.100 T 9 T 9 T 9 S 52
10 0.299 0.104 * G 10 G 10 G 10 G 53
11 0.276 0.031 * A 11 A 11 A 11 A 54
12 0.321 0.010 * A 12 A 12 A 12 A 55
13 0.294 0.126 * G 13 G 13 G 13 G 56
14 0.324 0.204 Q 14 Q 14 Q 14 M 57
15 0.299 0.158 * I 15 I 15 I 15 I 58
16 0.253 0.100 G 16 A 16 A 16 S 59
17 0.230 0.134 Y 17 Y 17 Y 17 N 60
18 0.493 0.306 S 18 S 18 S 18 H 61
19 0.340 0.096 * L 19 L 19 L 19 L 62
20 0.333 0.089 * L 20 L 20 L 20 L 63
21 0.459 0.033 F 21 Y 21 Y 21 F 64
22 0.291 0.103 R 22 S 22 S 22 K 65
23 0.246 0.077 I 23 I 23 I 23 L 66
24 0.224 0.068 A 24 G 24 G 24 A 67
25 0.357 0.146 A 25 N 25 N 25 S 68
26 0.318 0.110 * G 26 G 26 G 26 G 69
27 0.566 0.257 E 27 S 27 S 27 E 70
28 0.446 0.233 M 28 V 28 V 28 V 71
29 0.474 0.086 L 29 F 29 F 29 F 72
30 0.588 0.147 * G 30 G 30 G 30 G 73
31 0.362 0.171 K 31 K 31 K 31 Q 74
32 0.515 0.176 * D 32 D 32 D 32 D 75
33 0.303 0.036 * Q 33 Q 33 Q 33 Q 76
34 0.419 0.095 * P 34 P 34 P 34 P 77
35 0.366 0.062 V 35 I 35 I 35 I 78
36 0.459 0.043 I 36 I 36 I 36 A 79
37 0.257 0.079 * L 37 L 37 L 37 L 80
38 0.293 0.046 Q 38 V 38 V 38 K 81
39 0.254 0.077 * L 39 L 39 L 39 L 82
40 0.215 0.038 * L 40 L 40 L 40 L 83
41 0.229 0.054 E 41 D 41 D 41 G 84
42 0.653 0.101 I 42 I 42 I 42 S 85
43 0.761 0.170 P 43 T 43 T 43 E 86
44 1.172 0.441 Q 44 P 44 P 44 R 87
45 0.734 0.138 A 45 M 45 M 45 S 88
46 0.787 0.163 M 46 M 46 M 46 F 89
47 0.774 0.078 K 47 G 47 G 47 Q 90
48 0.600 0.201 A 48 V 48 V 48 A 91
49 0.772 0.135 * L 49 L 49 L 49 L 92
50 0.794 0.124 E 50 D 50 D 50 E 93
51 0.608 0.211 * G 51 G 51 G 51 G 94
52 0.525 0.078 * V 52 V 52 V 52 V 95
53 0.772 0.117 V 53 L 53 L 53 A 96
54 0.837 0.238 * M 54 M 54 M 54 M 97
55 0.593 0.154 * E 55 E 55 E 55 E 98
56 0.574 0.143 * L 56 L 56 L 56 L 99
57 1.016 0.194 E 57 Q 57 Q 57 E 100
58 1.042 0.202 * D 58 D 58 D 58 D 101
59 0.863 0.271 C 59 C 59 C 59 S 102
60 1.199 0.250 A 60 A 60 A 60 L 103
61 0.355 0.035 F 61 L 61 L 61 Y 104
62 0.529 0.198 * P 62 P 62 P 62 P 105
63 0.291 0.086 * L 63 L 63 L 63 L 106
64 0.321 0.089 * L 64 L 64 L 64 L 107
65 0.418 0.158 A 65 K 65 K 65 R 108
66 0.481 0.052 G 66 D 66 D 66 E 109
67 0.371 0.056 L 67 V 67 V 67 V 110
68 0.193 0.075 E 68 I 68 I 68 S 111
69 0.420 0.194 A 69 A 69 A 69 I 112
70 0.388 0.151 T 70 T 70 T 70 G 113
71 0.479 0.230 D 71 D 71 D 71 I 114
72 0.833 0.352 D 72 K 72 K 72 D 115
73 0.994 0.222 P 73 E 73 E 73 P 116
74 1.190 0.204 D 74 E 74 E 74 Y 117
75 0.656 0.289 V 75 I 75 I 75 E 118
76 0.418 0.128 A 76 A 76 A 76 V 119
77 0.539 0.108 * F 77 F 77 F 77 F 120
78 0.376 0.155 K 78 K 78 K 78 E 121
79 0.358 0.070 * D 79 D 79 D 79 D 122
80 0.307 0.107 A 80 L 80 L 80 V 123
81 0.178 0.050 * D 81 D 81 D 81 D 124
82 0.209 0.041 Y 82 V 82 V 82 W 125
83 0.202 0.048 * A 83 A 83 A 83 A 126
84 0.158 0.073 L 84 I 84 I 84 L 127
85 0.118 0.041 * L 85 L 85 L 85 L 128
86 0.145 0.048 V 86 V 86 V 86 I 129
87 0.339 0.029 * G 87 G 87 G 87 G 130
88 0.622 0.176 A 88 S 88 S 88 A 131
# =============================================
89 1.372 0.311 P 90 M 89 M 89 P 133
# =============================================
90 1.496 0.660 R 97 L 100 D 99 R 140
# =============================================
91 1.165 0.405 L 101 K 102 K 102 L 144
# =============================================
92 1.495 0.274 V 103 A 103 A 103 I 146
93 0.811 0.225 * N 104 N 104 N 104 N 147
94 1.108 0.429 G 105 V 105 V 105 G 148
95 0.866 0.336 K 106 K 106 K 106 Q 149
96 0.432 0.066 * I 107 I 107 I 107 I 150
97 0.405 0.097 * F 108 F 108 F 108 F 151
98 0.561 0.243 T 109 K 109 K 109 A 152
99 0.496 0.210 E 110 C 110 C 110 D 153
100 0.230 0.034 * Q 111 Q 111 Q 111 Q 154
101 0.193 0.099 * G 112 G 112 G 112 G 155
102 0.370 0.101 R 113 A 113 A 113 K 156
103 0.365 0.094 * A 114 A 114 A 114 A 157
104 0.256 0.035 * L 115 L 115 L 115 L 158
105 0.360 0.075 A 116 D 116 D 116 N 159
106 0.379 0.100 E 117 K 117 K 117 A 160
107 0.384 0.086 V 118 Y 118 Y 118 V 161
108 0.246 0.088 * A 119 A 119 A 119 A 162
109 0.416 0.073 K 120 K 120 K 120 S 163
110 0.371 0.072 * K 121 K 121 K 121 K 164
111 0.362 0.045 D 122 S 122 S 122 N 165
112 0.189 0.057 * V 123 V 123 V 123 V 166
113 0.232 0.078 * K 124 K 124 K 124 K 167
114 0.254 0.092 * V 125 V 125 V 125 V 168
115 0.213 0.085 L 126 I 126 I 126 L 169
116 0.223 0.066 * V 127 V 127 V 127 V 170
117 0.263 0.051 * V 128 V 128 V 128 V 171
118 0.294 0.077 * G 129 G 129 G 129 G 172
119 0.363 0.091 * N 130 N 130 N 130 N 173
120 0.420 0.089 * P 131 P 131 P 131 P 174
121 0.395 0.156 A 132 A 132 A 132 C 175
122 0.271 0.064 * N 133 N 133 N 133 N 176
123 0.269 0.047 * T 134 T 134 T 134 T 177
124 0.229 0.078 * N 135 N 135 N 135 N 178
125 0.237 0.084 A 136 C 136 C 136 A 179
126 0.274 0.136 * L 137 L 137 L 137 L 180
127 0.320 0.090 I 138 T 138 T 138 I 181
128 0.174 0.062 A 139 A 139 A 139 C 182
129 0.226 0.121 Y 140 S 140 S 140 L 183
130 0.230 0.078 * K 141 K 141 K 141 K 184
131 0.225 0.096 N 142 S 142 S 142 N 185
132 0.318 0.153 * A 143 A 143 A 143 A 186
133 0.758 0.416 * P 144 P 144 P 144 P 187
134 0.254 0.172 G 145 S 145 S 145 D 188
135 0.231 0.112 L 146 I 146 I 146 I 189
136 0.241 0.067 N 147 P 147 P 147 P 190
137 0.329 0.203 P 148 K 148 K 148 A 191
138 0.443 0.255 R 149 E 149 E 149 K 192
139 0.351 0.108 * N 150 N 150 N 150 N 193
140 0.365 0.093 * F 151 F 151 F 151 F 194
141 0.430 0.093 T 152 S 152 S 152 H 195
142 0.402 0.202 A 153 C 153 C 153 A 196
143 0.114 0.044 M 154 L 154 L 154 L 197
144 0.260 0.121 * T 155 T 155 T 155 T 198
145 0.152 0.070 * R 156 R 156 R 156 R 199
146 0.216 0.104 * L 157 L 157 L 157 L 200
147 0.304 0.124 * D 158 D 158 D 158 D 201
148 0.212 0.111 H 159 H 159 H 159 E 202
149 0.208 0.068 * N 160 N 160 N 160 N 203
150 0.387 0.143 * R 161 R 161 R 161 R 204
151 0.225 0.053 * A 162 A 162 A 162 A 205
152 0.134 0.044 * K 163 K 163 K 163 K 206
153 0.345 0.073 A 164 A 164 A 164 C 207
154 0.269 0.124 * Q 165 Q 165 Q 165 Q 208
155 0.273 0.128 L 166 I 166 I 166 L 209
156 0.528 0.154 * A 167 A 167 A 167 A 210
157 0.609 0.148 K 168 L 168 L 168 L 211
158 0.494 0.182 * K 169 K 169 K 169 K 212
159 0.680 0.235 T 170 L 170 L 170 A 213
160 0.896 0.250 * G 171 G 171 G 171 G 214
161 0.753 0.075 T 172 V 172 V 172 V 215
162 0.765 0.137 G 173 T 173 T 173 F 216
163 0.657 0.086 V 174 S 174 S 174 Y 217
164 0.556 0.123 * D 175 D 175 D 175 D 218
165 0.561 0.255 R 176 D 176 D 176 K 219
166 0.382 0.206 I 177 V 177 V 177 V 220
167 0.458 0.194 R 178 K 178 K 178 S 221
168 0.295 0.068 R 179 N 179 N 179 N 222
169 0.448 0.131 M 180 V 180 V 180 V 223
170 0.371 0.117 T 181 I 181 I 181 T 224
171 0.288 0.132 V 182 I 182 I 182 I 225
172 0.271 0.083 * W 183 W 183 W 183 W 226
173 0.325 0.042 * G 184 G 184 G 184 G 227
174 0.329 0.095 * N 185 N 185 N 185 N 228
175 0.304 0.088 * H 186 H 186 H 186 H 229
176 0.369 0.143 * S 187 S 187 S 187 S 230
177 0.281 0.133 S 188 S 188 S 188 T 231
178 0.256 0.143 * T 189 T 189 T 189 T 232
179 0.313 0.134 M 190 Q 190 Q 190 Q 233
180 0.294 0.111 F 191 Y 191 Y 191 V 234
181 0.238 0.047 * P 192 P 192 P 192 P 235
182 0.263 0.114 * D 193 D 193 D 193 D 236
183 0.604 0.207 L 194 V 194 V 194 F 237
184 0.482 0.292 F 195 N 195 N 195 L 238
185 0.608 0.367 H 196 H 196 H 196 N 239
186 0.628 0.377 * A 197 A 197 A 197 A 240
187 0.565 0.305 E 198 K 198 K 198 K 241
188 0.371 0.174 V 199 V 199 V 199 I 242
189 0.795 0.324 D 200 K 200 K 200 D 243
# =============================================
190 1.321 0.593 G 205 E 205 E 205 G 244
191 0.799 0.457 R 206 V 206 V 206 R 245
192 0.612 0.232 P 207 G 207 G 207 P 246
193 0.425 0.096 A 208 V 208 V 208 V 247
194 0.462 0.183 L 209 Y 209 Y 209 K 248
195 0.522 0.253 * E 210 E 210 E 210 E 249
196 0.625 0.274 L 211 A 211 A 211 V 250
197 0.772 0.341 V 212 V 212 V 212 I 251
# =============================================
198 0.870 0.543 D 214 D 214 D 214 R 253
199 0.648 0.389 M 215 D 215 D 215 T 254
200 0.472 0.189 E 216 S 216 S 216 K 255
201 0.363 0.204 * W 217 W 217 W 217 W 256
202 0.362 0.129 Y 218 L 218 L 218 L 257
203 0.853 0.379 E 219 K 219 K 219 E 258
204 0.927 0.476 K 220 G 220 G 220 E 259
205 0.671 0.252 V 221 E 221 E 221 E 260
206 0.405 0.041 * F 222 F 222 F 222 F 261
207 0.509 0.158 I 223 I 223 I 223 T 262
208 0.581 0.117 P 224 T 224 T 224 I 263
209 0.671 0.138 * T 225 T 225 T 225 T 264
210 0.612 0.069 * V 226 V 226 V 226 V 265
211 0.913 0.182 A 227 Q 227 Q 227 Q 266
212 1.211 0.272 Q 228 Q 228 Q 228 K 267
213 1.124 0.293 * R 229 R 229 R 229 R 268
214 1.315 0.355 * G 230 G 230 G 230 G 269
# =============================================
215 0.560 0.178 A 231 A 232 A 232 G 270
# =============================================
216 1.497 0.308 I 233 V 233 V 233 L 272
217 1.773 0.425 * I 234 I 234 I 234 I 273
# =============================================
218 0.868 0.261 Q 235 A 236 A 236 Q 274
# =============================================
219 1.181 0.249 G 238 R 237 R 237 G 277
# =============================================
220 1.577 0.254 A 239 L 239 L 239 R 278
221 1.506 0.333 * S 240 S 240 S 240 S 279
222 1.241 0.445 * S 241 S 241 S 241 S 280
223 0.474 0.254 * A 242 A 242 A 242 A 281
224 0.521 0.188 A 243 M 243 M 243 A 282
225 0.577 0.241 * S 244 S 244 S 244 S 283
226 0.418 0.244 A 245 A 245 A 245 T 284
227 0.328 0.151 * A 246 A 246 A 246 A 285
228 0.330 0.133 N 247 K 247 K 247 V 286
229 0.297 0.149 A 248 A 248 A 248 S 287
230 0.326 0.153 A 249 I 249 I 249 I 288
231 0.306 0.167 I 250 C 250 C 250 A 289
232 0.282 0.134 E 251 D 251 D 251 D 290
233 0.257 0.108 H 252 H 252 H 252 A 291
234 0.338 0.206 I 253 V 253 V 253 I 292
235 0.411 0.250 R 254 R 254 R 254 K 293
236 0.397 0.188 D 255 D 255 D 255 S 294
237 0.482 0.099 W 256 I 256 I 256 L 295
238 0.774 0.317 A 257 W 257 W 257 V 296
239 0.761 0.418 L 258 F 258 F 258 T 297
240 1.078 0.586 G 259 G 259 G 259 P 298
241 0.633 0.358 * T 260 T 260 T 260 T 299
242 0.728 0.329 * P 261 P 261 P 261 P 300
243 0.812 0.367 * E 262 E 262 E 262 E 301
244 0.728 0.413 * G 263 G 263 G 263 G 302
245 0.479 0.189 D 264 E 264 E 264 D 303
246 0.271 0.088 W 265 F 265 F 265 W 304
247 0.244 0.088 V 266 V 266 V 266 F 305
248 0.173 0.045 * S 267 S 267 S 267 S 306
249 0.304 0.154 M 268 M 268 M 268 T 307
250 0.251 0.136 A 269 G 269 G 269 G 308
251 0.254 0.141 V 270 I 270 I 270 V 309
252 0.347 0.104 P 271 I 271 I 271 Y 310
253 0.368 0.041 S 272 S 272 S 272 T 311
254 0.547 0.336 Q 273 D 273 D 273 T 312
255 1.531 0.957 * G 274 G 274 G 274 G 313
256 0.747 0.376 E 275 N 275 N 275 N 314
# =============================================
257 0.577 0.110 * Y 277 Y 277 Y 277 Y 316
258 0.928 0.089 * G 278 G 278 G 278 G 317
259 0.416 0.152 I 279 V 279 V 279 I 318
260 0.469 0.115 P 280 P 280 P 280 A 319
261 0.453 0.153 E 281 D 281 D 281 E 320
262 0.595 0.192 G 282 D 282 D 282 D 321
263 0.650 0.172 I 283 L 283 L 283 I 322
264 0.267 0.055 V 284 L 284 L 284 V 323
265 0.158 0.066 Y 285 Y 285 Y 285 F 324
266 0.228 0.081 * S 286 S 286 S 286 S 325
267 0.233 0.100 F 287 F 287 F 287 M 326
268 0.236 0.086 * P 288 P 288 P 288 P 327
269 0.290 0.094 V 289 V 289 V 289 C 328
270 0.318 0.061 T 290 T 290 T 290 R 329
271 0.319 0.130 A 291 I 291 I 291 S 330
272 0.700 0.148 * K 292 K 292 K 292 K 331
# =============================================
273 1.144 0.139 * D 293 D 293 D 293 D 333
274 0.824 0.353 G 294 K 294 K 294 G 334
275 0.820 0.403 A 295 T 295 T 295 D 335
276 0.428 0.096 Y 296 W 296 W 296 Y 336
277 0.335 0.179 R 297 K 297 K 297 E 337
278 0.347 0.081 V 298 I 298 I 298 L 338
279 0.382 0.098 V 299 V 299 V 299 A 339
280 0.666 0.297 E 300 E 300 E 300 T 340
# =============================================
281 0.788 0.395 L 302 L 302 L 302 V 342
282 0.819 0.396 E 303 P 303 P 303 S 343
283 0.406 0.093 I 304 I 304 I 304 N 344
284 0.404 0.158 N 305 N 305 N 305 D 345
285 0.417 0.211 E 306 D 306 D 306 D 346
286 0.273 0.055 * F 307 F 307 F 307 F 347
287 0.333 0.139 A 308 S 308 S 308 L 348
288 0.456 0.277 R 309 R 309 R 309 W 349
289 0.219 0.130 K 310 E 310 E 310 E 350
290 0.273 0.139 R 311 K 311 K 311 R 351
291 0.310 0.168 M 312 M 312 M 312 I 352
292 0.310 0.134 E 313 D 313 D 313 K 353
293 0.320 0.156 I 314 L 314 L 314 K 354
294 0.304 0.116 T 315 T 315 T 315 S 355
295 0.269 0.143 A 316 A 316 A 316 E 356
296 0.312 0.081 Q 317 K 317 K 317 A 357
297 0.321 0.116 * E 318 E 318 E 318 E 358
298 0.269 0.148 * L 319 L 319 L 319 L 359
299 0.341 0.078 L 320 A 320 A 320 L 360
300 0.499 0.088 D 321 E 321 E 321 A 361
301 0.448 0.096 * E 322 E 322 E 322 E 362
302 0.362 0.121 M 323 K 323 K 323 K 363
303 0.629 0.187 E 324 E 324 E 324 K 364
304 0.692 0.193 Q 325 T 325 T 325 C 365
305 0.964 0.142 V 326 A 326 A 326 V 366
306 1.061 0.243 K 327 F 327 F 327 A 367
# =============================================
307 1.156 0.429 G 330 S 331 S 331 H 368
# =============================================
Least-squares dynamic programming alignment:
FIT_ATOMS atoms for alignment : CA
Max dist from frw for equivalence : 3.5000
Gap introduction penalty : 0.0000
Gap extension penalty : 1.7500
Numb of residues in framework : 307
COMPARISON OF SEVERAL 3D STRUCTURES:
# ALGNMT CODE ATOM FILE
1 1bmdA ./1bmd.pdb
2 4mdhA ./4mdh.pdb
3 5mdhA ./5mdh.pdb
4 7mdhA ./7mdh.pdb
Variability at a given position is calculated as:
VAR = 1/Nij * sum_ij (feat_i - feat_j)
sum runs over all pairs of proteins with residues present.
>> Least-squares superposition (FIT) : T
Atom types for superposition/RMS (FIT_ATOMS): CA
Atom type for position average/variability (DISTANCE_ATOMS[1]): CA
Position comparison (FIT_ATOMS):
Cutoff for RMS calculation: 3.5000
Upper = RMS, Lower = numb equiv positions
1bmdA 4mdhA 5mdhA 7mdhA
1bmdA 0.000 1.038 0.979 0.996
4mdhA 310 0.000 0.505 1.221
5mdhA 308 329 0.000 1.183
7mdhA 321 307 307 0.000
Distance comparison (FIT_ATOMS):
Cutoff for rms calculation: 3.5000
Upper = Distance RMS, Lower = numb equiv distances
1bmdA 4mdhA 5mdhA 7mdhA
1bmdA 0.000 0.774 0.755 0.786
4mdhA 47810 0.000 0.375 0.925
5mdhA 47777 53956 0.000 0.906
7mdhA 51633 47388 47412 0.000
>> Sequence comparison:
Diag=numb res, Upper=numb equiv res, Lower = % seq ID
1bmdA 4mdhA 5mdhA 7mdhA
1bmdA 327 168 168 159
4mdhA 51 333 328 137
5mdhA 51 98 333 137
7mdhA 49 41 41 351
>> Dihedral angle comparison: Alph
Cutoff for rms comparison: 60.0000
Upper = RMS Alph, Lower = numb of equiv angles
1bmdA 4mdhA 5mdhA 7mdhA
1bmdA 0.000 12.053 11.570 13.322
4mdhA 299 0.000 9.210 14.437
5mdhA 300 324 0.000 13.993
7mdhA 310 297 300 0.000
>> Dihedral angle comparison: Phi
Cutoff for rms comparison: 60.0000
Upper = RMS Phi , Lower = numb of equiv angles
1bmdA 4mdhA 5mdhA 7mdhA
1bmdA 0.000 15.460 14.518 14.875
4mdhA 296 0.000 13.707 18.263
5mdhA 299 323 0.000 15.457
7mdhA 311 294 294 0.000
>> Dihedral angle comparison: Psi
Cutoff for rms comparison: 15.0000
Upper = RMS Psi , Lower = numb of equiv angles
1bmdA 4mdhA 5mdhA 7mdhA
1bmdA 0.000 7.418 7.142 7.707
4mdhA 211 0.000 7.268 7.546
5mdhA 223 246 0.000 8.048
7mdhA 234 184 200 0.000
>> Dihedral angle comparison: Omeg
Cutoff for rms comparison: 60.0000
Upper = RMS Omeg, Lower = numb of equiv angles
1bmdA 4mdhA 5mdhA 7mdhA
1bmdA 0.000 4.906 5.238 4.369
4mdhA 310 0.000 4.755 3.585
5mdhA 310 328 0.000 4.321
7mdhA 321 309 309 0.000
>> Dihedral angle comparison: chi1
Cutoff for rms comparison: 60.0000
Upper = RMS chi1, Lower = numb of equiv angles
1bmdA 4mdhA 5mdhA 7mdhA
1bmdA 0.000 21.445 18.038 16.534
4mdhA 166 0.000 19.816 20.187
5mdhA 168 232 0.000 16.511
7mdhA 169 158 165 0.000
>> Dihedral angle comparison: chi2
Cutoff for rms comparison: 60.0000
Upper = RMS chi2, Lower = numb of equiv angles
1bmdA 4mdhA 5mdhA 7mdhA
1bmdA 0.000 24.979 21.779 24.006
4mdhA 96 0.000 22.089 26.661
5mdhA 103 147 0.000 20.207
7mdhA 114 95 91 0.000
>> Dihedral angle comparison: chi3
Cutoff for rms comparison: 60.0000
Upper = RMS chi3, Lower = numb of equiv angles
1bmdA 4mdhA 5mdhA 7mdhA
1bmdA 0.000 29.373 25.539 33.427
4mdhA 29 0.000 29.748 29.955
5mdhA 33 51 0.000 28.313
7mdhA 39 26 32 0.000
>> Dihedral angle comparison: chi4
Cutoff for rms comparison: 60.0000
Upper = RMS chi4, Lower = numb of equiv angles
1bmdA 4mdhA 5mdhA 7mdhA
1bmdA 0.000 32.191 21.295 21.449
4mdhA 11 0.000 24.266 21.035
5mdhA 7 20 0.000 18.541
7mdhA 10 9 9 0.000
>> Dihedral angle comparison: chi5
Cutoff for rms comparison: 60.0000
Upper = RMS chi5, Lower = numb of equiv angles
1bmdA 4mdhA 5mdhA 7mdhA
1bmdA 0.000 0.000 0.000 0.000
4mdhA 0 0.000 0.000 0.000
5mdhA 0 0 0.000 0.000
7mdhA 0 0 0 0.000
>> Ramachandran mainchain class substitution
prot 1 --> prot 2; class on vert --> class on horiz
A P B L E U
A 1042 5 6 5 0 0
P 12 202 49 1 0 2
B 9 49 379 4 2 0
L 21 1 4 75 0 0
E 0 2 0 0 13 0
U 1 2 0 0 1 2
Summary (% does not count undefined):
CODE # ID # NID # TOT % ID % NID % TOT
A 1042 16 1058 55.3 0.8 56.2
P 202 64 266 10.7 3.4 14.1
B 379 64 443 20.1 3.4 23.5
L 75 26 101 4.0 1.4 5.4
E 13 2 15 0.7 0.1 0.8
--------------------------------------------
SUMS 1711 172 1883 90.9 9.1 100.0
--------------------------------------------
U 2 4 6 0.1 0.2 0.3
>> Dihedral class substitution: Alph
prot 1 --> prot 2; class on vert --> class on horiz
1 2 3 4
1 62 8 33 0
2 4 1058 22 0
3 27 25 640 2
4 2 2 1 3
Summary (% does not count undefined):
CODE # ID # NID # TOT % ID % NID % TOT
1 62 41 103 3.3 2.2 5.5
2 1058 26 1084 56.2 1.4 57.6
3 640 54 694 34.0 2.9 36.9
--------------------------------------------
SUMS 1760 121 1881 93.6 6.4 100.0
--------------------------------------------
4 3 5 8 0.2 0.3 0.4
>> Dihedral class substitution: Phi
prot 1 --> prot 2; class on vert --> class on horiz
1 2 3 4
1 1047 6 98 2
2 15 85 13 0
3 92 6 521 0
4 2 1 0 1
Summary (% does not count undefined):
CODE # ID # NID # TOT % ID % NID % TOT
1 1047 106 1153 55.5 5.6 61.2
2 85 28 113 4.5 1.5 6.0
3 521 98 619 27.6 5.2 32.8
--------------------------------------------
SUMS 1653 232 1885 87.7 12.3 100.0
--------------------------------------------
4 1 3 4 0.1 0.2 0.2
>> Dihedral class substitution: Psi
prot 1 --> prot 2; class on vert --> class on horiz
1 2 3 4
1 884 48 10 0
2 57 198 32 0
3 14 30 614 0
4 1 0 0 1
Summary (% does not count undefined):
CODE # ID # NID # TOT % ID % NID % TOT
1 884 58 942 46.8 3.1 49.9
2 198 89 287 10.5 4.7 15.2
3 614 44 658 32.5 2.3 34.9
--------------------------------------------
SUMS 1696 191 1887 89.9 10.1 100.0
--------------------------------------------
4 1 1 2 0.1 0.1 0.1
>> Dihedral class substitution: Omeg
prot 1 --> prot 2; class on vert --> class on horiz
1 2 3 4
1 1881 0 0 0
2 0 6 0 0
3 0 0 0 0
4 1 0 0 1
Summary (% does not count undefined):
CODE # ID # NID # TOT % ID % NID % TOT
1 1881 0 1881 99.7 0.0 99.7
2 6 0 6 0.3 0.0 0.3
3 0 0 0 0.0 0.0 0.0
--------------------------------------------
SUMS 1887 0 1887 100.0 0.0 100.0
--------------------------------------------
4 1 1 2 0.1 0.1 0.1
>> Dihedral class substitution: chi1
prot 1 --> prot 2; class on vert --> class on horiz
1 2 3 4
1 657 125 54 45
2 151 279 34 26
3 42 42 58 15
4 63 55 15 228
Summary (% does not count undefined):
CODE # ID # NID # TOT % ID % NID % TOT
1 657 224 881 43.0 14.7 57.7
2 279 211 490 18.3 13.8 32.1
3 58 99 157 3.8 6.5 10.3
--------------------------------------------
SUMS 994 534 1528 65.1 34.9 100.0
--------------------------------------------
4 228 133 361 12.1 7.0 19.1
>> Dihedral class substitution: chi2
prot 1 --> prot 2; class on vert --> class on horiz
1 2 3 4
1 496 111 16 126
2 127 139 13 47
3 22 24 29 8
4 124 52 11 544
Summary (% does not count undefined):
CODE # ID # NID # TOT % ID % NID % TOT
1 496 253 749 42.8 21.8 64.7
2 139 187 326 12.0 16.1 28.2
3 29 54 83 2.5 4.7 7.2
--------------------------------------------
SUMS 664 494 1158 57.3 42.7 100.0
--------------------------------------------
4 544 187 731 28.8 9.9 38.7
>> Dihedral class substitution: chi3
prot 1 --> prot 2; class on vert --> class on horiz
1 2 3 4
1 197 44 12 99
2 42 36 9 41
3 15 6 4 18
4 91 16 8 1251
Summary (% does not count undefined):
CODE # ID # NID # TOT % ID % NID % TOT
1 197 155 352 37.7 29.6 67.3
2 36 92 128 6.9 17.6 24.5
3 4 39 43 0.8 7.5 8.2
--------------------------------------------
SUMS 237 286 523 45.3 54.7 100.0
--------------------------------------------
4 1251 115 1366 66.2 6.1 72.3
>> Dihedral class substitution: chi4
prot 1 --> prot 2; class on vert --> class on horiz
1 2 3 4
1 55 9 12 52
2 12 9 5 10
3 17 3 4 19
4 53 15 15 1599
Summary (% does not count undefined):
CODE # ID # NID # TOT % ID % NID % TOT
1 55 73 128 26.6 35.3 61.8
2 9 27 36 4.3 13.0 17.4
3 4 39 43 1.9 18.8 20.8
--------------------------------------------
SUMS 68 139 207 32.9 67.1 100.0
--------------------------------------------
4 1599 83 1682 84.6 4.4 89.0
>> Dihedral class substitution: chi5
prot 1 --> prot 2; class on vert --> class on horiz
1 2 3 4
1 0 0 0 0
2 0 0 0 0
3 0 0 0 0
4 0 0 0 1889
Summary (% does not count undefined):
CODE # ID # NID # TOT % ID % NID % TOT
1 0 0 0 0.0 0.0 0.0
2 0 0 0 0.0 0.0 0.0
3 0 0 0 0.0 0.0 0.0
--------------------------------------------
SUMS 0 0 0 0.0 0.0 0.0
--------------------------------------------
4 1889 0 1889 100.0 0.0 100.0
>> Detailed comparison:
Structure : 2 ./4mdh.pdb
Structure : 3 ./5mdh.pdb
Structure : 4 ./7mdh.pdb
ALN ... alignment position
RESID... ... residue numbers 1/2/3
AAA ... amino acid types 1/2/3
MNC ... mainchain classes 1/2/3
ALP... ... dihedral angle classes (alpha,phi,psi,...)
ALN RESIDUE_NUMBERS AAA MNC ALP PHI PSI OMG CH1 CH2 CH3 CH4 CH5
---------------------------------------------------------------
1 ---- ---- 23 --D --U --4 --4 --3 --1 --1 --1 --4 --4 --4
2 ---- ---- 24 --C --B --3 --3 --3 --1 --3 --4 --4 --4 --4
3 ---- ---- 25 --F --B --1 --3 --3 --1 --2 --1 --4 --4 --4
4 ---- ---- 26 --G --E --1 --2 --3 --1 --4 --4 --4 --4 --4
5 ---- ---- 27 --V --A --2 --1 --1 --1 --2 --4 --4 --4 --4
6 ---- ---- 28 --F --A --2 --1 --1 --1 --1 --1 --4 --4 --4
7 ---- ---- 29 --C --B --2 --3 --2 --1 --1 --4 --4 --4 --4
8 ---- ---- 30 --T --A --2 --3 --1 --2 --3 --4 --4 --4 --4
9 ---- ---- 43 --W --E --2 --2 --3 --1 --1 --3 --4 --4 --4
10 1 1 44 SSK UUP 441 441 233 111 221 441 443 441 444
11 2 2 45 EEK BPP 333 311 333 111 212 221 211 442 444
12 3 3 46 PPL PPP 333 111 223 111 222 112 224 444 444
13 4 4 47 IIV BPB 333 333 333 111 222 114 444 444 444
14 5 5 48 RRN BBB 333 333 333 111 121 112 314 314 444
15 6 6 49 VVI BBB 333 333 333 111 111 441 444 444 444
16 7 7 50 LLA BBB 333 333 333 111 224 224 444 444 444
17 8 8 51 VVV BBB 333 333 333 111 111 444 444 444 444
18 9 9 52 TTS PPP 222 133 333 111 221 444 444 444 444
19 10 10 53 GGG LLL 333 222 222 111 444 444 444 444 444
20 11 11 54 AAA AAA 222 111 111 111 444 444 444 444 444
21 12 12 55 AAA AAA 222 333 222 111 444 444 444 444 444
22 13 13 56 GGG PPP 133 311 333 111 444 444 444 444 444
23 14 14 57 QQM AAA 222 111 111 111 221 111 112 444 444
24 15 15 58 III AAA 222 111 111 111 111 111 444 444 444
25 16 16 59 AAS AAA 222 111 111 111 443 444 444 444 444
26 17 17 60 YYN AAA 222 111 111 111 222 222 444 444 444
27 18 18 61 SSH AAA 222 133 111 111 221 441 444 444 444
28 19 19 62 LLL AAA 222 331 111 111 222 222 444 444 444
29 20 20 63 LLL AAA 222 111 111 111 111 111 444 444 444
30 21 21 64 YYF AAA 222 111 111 111 221 222 444 444 444
31 22 22 65 SSK AAA 222 111 111 111 221 441 441 442 444
32 23 23 66 IIL AAA 222 111 111 111 111 111 444 444 444
33 24 24 67 GGA AAA 222 111 211 111 444 444 444 444 444
34 25 25 68 NNS AAA 333 111 111 111 131 114 444 444 444
35 26 26 69 GGG LLL 233 222 222 111 444 444 444 444 444
36 27 27 70 SSE AAA 222 111 221 111 113 441 441 444 444
37 28 28 71 VVV AAA 222 331 111 111 111 444 444 444 444
38 29 29 72 FFF AAA 113 333 212 111 111 211 444 444 444
39 30 30 73 GGG EEE 331 232 333 111 444 444 444 444 444
40 31 31 74 KKQ AAA 222 111 111 111 111 112 111 114 444
41 32 32 75 DDD AAA 222 333 222 111 313 111 444 444 444
42 33 33 76 QQQ BBB 333 333 333 111 222 333 111 444 444
43 34 34 77 PPP PPP 333 111 222 111 232 121 212 444 444
44 35 35 78 III PBB 333 333 333 111 112 121 444 444 444
45 36 36 79 IIA BBB 333 333 333 111 114 114 444 444 444
46 37 37 80 LLL BBB 333 333 333 111 221 211 444 444 444
47 38 38 81 VVK BBB 333 333 333 111 111 442 441 443 444
48 39 39 82 LLL BBB 333 333 333 111 111 121 444 444 444
49 40 40 83 LLL BBB 333 333 333 111 222 222 444 444 444
50 41 41 84 DDG BBB 111 333 333 111 224 214 444 444 444
51 42 42 85 IIS PPP 333 331 333 111 221 114 444 444 444
52 43 43 86 TTE AAA 222 111 111 111 113 442 441 444 444
53 44 44 87 PPR AAA 222 111 111 111 322 113 221 441 444
54 45 45 88 MMS AAA 222 333 222 111 112 224 114 444 444
55 46 46 89 MMF AAA 222 111 111 111 112 222 324 444 444
56 47 47 90 GGQ AAA 222 111 111 111 442 441 441 444 444
57 48 48 91 VVA AAA 222 111 111 111 114 444 444 444 444
58 49 49 92 LLL AAA 222 111 111 111 121 121 444 444 444
59 50 50 93 DDE AAA 222 111 111 111 111 111 441 444 444
60 51 51 94 GGG AAA 222 111 111 111 444 444 444 444 444
61 52 52 95 VVV AAA 222 111 111 111 111 444 444 444 444
62 53 53 96 LLA AAA 222 111 111 111 114 114 444 444 444
63 54 54 97 MMM AAA 222 111 111 111 111 111 132 444 444
64 55 55 98 EEE AAA 222 111 111 111 111 111 111 444 444
65 56 56 99 LLL AAA 222 111 111 111 111 111 444 444 444
66 57 57 100 QQE AAA 222 111 111 111 111 111 111 444 444
67 58 58 101 DDD AAA 222 111 111 111 111 111 444 444 444
68 59 59 102 CCS AAA 333 333 221 111 112 444 444 444 444
69 60 60 103 AAL LLL 333 222 322 111 441 441 444 444 444
70 61 61 104 LLY BBP 333 331 333 111 111 111 444 444 444
71 62 62 105 PPP AAA 222 111 111 111 322 211 122 444 444
72 63 63 106 LLL AAA 222 111 111 111 111 111 444 444 444
73 64 64 107 LLL BBB 333 111 333 111 112 112 444 444 444
74 65 65 108 KKR AAA 112 111 111 111 121 112 112 131 444
75 66 66 109 DDE BBB 333 333 333 111 221 211 441 444 444
76 67 67 110 VVV BBB 333 333 333 111 111 444 444 444 444
77 68 68 111 IIS BBB 333 333 333 111 111 314 444 444 444
78 69 69 112 AAI BBB 333 333 333 111 442 441 444 444 444
79 70 70 113 TTG BBB 333 333 333 111 334 444 444 444 444
80 71 71 114 DDI AAA 222 333 222 111 332 111 444 444 444
81 72 72 115 KKD BBB 333 333 333 111 112 111 114 124 444
82 73 73 116 EEP AAA 222 311 211 111 312 311 112 444 444
83 74 74 117 EEY AAA 222 111 111 111 111 332 114 444 444
84 75 75 118 IIE AAA 222 313 111 111 112 123 441 444 444
85 76 76 119 AAV AAA 222 111 111 111 441 444 444 444 444
86 77 77 120 FFF AAA 333 331 112 111 111 211 444 444 444
87 78 78 121 KKE PPP 111 111 333 111 223 111 211 314 444
88 79 79 122 DDD LLL 333 222 222 111 111 111 444 444 444
89 80 80 123 LLV PPP 333 111 333 111 112 114 444 444 444
90 81 81 124 DDD AAA 222 333 111 111 111 111 444 444 444
91 82 82 125 VVW BBB 333 333 333 111 111 441 444 444 444
92 83 83 126 AAA BBB 333 333 333 111 444 444 444 444 444
93 84 84 127 IIL BBB 333 333 333 111 111 111 444 444 444
94 85 85 128 LLL BBB 333 333 333 111 111 111 444 444 444
95 86 86 129 VVI AAA 222 133 111 111 111 441 444 444 444
96 87 87 130 GGG PPP 223 111 333 111 444 444 444 444 444
97 88 88 131 SSA BBB 133 333 333 111 134 444 444 444 444
98 ---- ---- 132 --K --P --3 --1 --3 --1 --1 --3 --1 --1 --4
99 89 89 133 MMP PBP 331 111 332 111 122 111 222 444 444
100 90 90 ---- PP- PP- 33- 11- 22- 11- 22- 11- 22- 44- 44-
101 91 91 ---- RR- PP- 33- 11- 33- 11- 23- 31- 11- 21- 44-
102 92 92 ---- RR- BB- 11- 33- 33- 11- 33- 11- 11- 22- 44-
103 93 93 ---- DD- PP- 22- 11- 33- 11- 12- 21- 44- 44- 44-
104 94 94 ---- GG- LL- 22- 22- 22- 11- 44- 44- 44- 44- 44-
105 95 95 ---- MM- AB- 23- 33- 13- 11- 31- 31- 32- 44- 44-
106 ---- 96 ---- -E- -P- -3- -1- -3- -1- -1- -1- -1- -4- -4-
107 ---- 97 ---- -R- -A- -2- -1- -1- -1- -1- -1- -1- -3- -4-
108 ---- 98 ---- -K- -A- -2- -1- -1- -1- -1- -2- -1- -3- -4-
109 96 ---- ---- E-- A-- 2-- 3-- 2-- 1-- 1-- 1-- 1-- 4-- 4--
110 97 ---- ---- R-- A-- 1-- 3-- 1-- 1-- 2-- 1-- 1-- 1-- 4--
111 98 ---- ---- K-- B-- 3-- 3-- 3-- 1-- 1-- 2-- 1-- 1-- 4--
112 99 ---- ---- D-- B-- 3-- 3-- 2-- 1-- 1-- 1-- 4-- 4-- 4--
113 ---- ---- 134 --R --P --3 --1 --3 --1 --2 --1 --1 --1 --4
114 ---- ---- 135 --G --P --1 --1 --3 --1 --4 --4 --4 --4 --4
115 ---- ---- 136 --P --P --1 --1 --2 --1 --2 --1 --2 --4 --4
116 ---- ---- 137 --G --L --3 --2 --2 --1 --4 --4 --4 --4 --4
117 ---- ---- ---- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ---
118 ---- ---- ---- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- ---
119 ---- ---- 138 --M --B --3 --3 --3 --1 --2 --1 --1 --4 --4
120 ---- ---- 139 --E --P --3 --1 --3 --1 --3 --2 --1 --4 --4
121 100 99 140 LDR APA 322 311 231 111 122 113 441 441 444
122 101 100 ---- LL- PL- 32- 13- 31- 11- 21- 11- 44- 44- 44-
123 ---- 101 ---- -L- -A- -2- -1- -1- -1- -2- -3- -4- -4- -4-
124 ---- ---- 141 --A --A --2 --1 --1 --1 --4 --4 --4 --4 --4
125 ---- ---- 142 --A --A --2 --1 --1 --1 --4 --4 --4 --4 --4
126 ---- ---- 143 --L --A --2 --1 --1 --1 --2 --2 --4 --4 --4
127 102 102 144 KKL AAA 222 311 111 111 111 111 114 124 444
128 ---- ---- 145 --D --A --2 --1 --1 --1 --2 --1 --4 --4 --4
129 103 103 146 AAI AAA 222 111 111 111 441 441 444 444 444
130 104 104 147 NNN AAA 222 131 111 111 111 111 444 444 444
131 105 105 148 VVG AAA 222 111 111 111 334 444 444 444 444
132 106 106 149 KKQ AAA 222 111 111 111 122 221 131 234 444
133 107 107 150 III AAA 222 111 111 111 111 121 444 444 444
134 108 108 151 FFF AAA 222 111 111 111 111 122 444 444 444
135 109 109 152 KKA AAA 222 111 111 111 224 114 114 114 444
136 110 110 153 CCD AAA 222 111 111 111 112 441 444 444 444
137 111 111 154 QQQ AAA 222 111 111 111 111 111 212 444 444
138 112 112 155 GGG AAA 222 111 111 111 444 444 444 444 444
139 113 113 156 AAK AAA 222 111 111 111 441 441 441 441 444
140 114 114 157 AAA AAA 222 111 111 111 444 444 444 444 444
141 115 115 158 LLL AAA 222 111 111 111 111 111 444 444 444
142 116 116 159 DDN AAA 222 111 111 111 222 112 444 444 444
143 117 117 160 KKA AAA 222 111 111 111 114 114 234 114 444
144 118 118 161 YYV AAA 222 333 111 111 112 114 444 444 444
145 119 119 162 AAA PPP 131 111 333 111 444 444 444 444 444
146 120 120 163 KKS PPP 333 111 333 111 113 114 114 214 444
147 121 121 164 KKK AAA 222 111 111 111 111 322 111 111 444
148 122 122 165 SSN AAA 333 313 122 111 112 441 444 444 444
149 123 123 166 VVV PPP 333 111 333 111 323 444 444 444 444
150 124 124 167 KKK BBB 333 333 333 111 111 222 111 131 444
151 125 125 168 VVV PBB 333 333 333 111 111 444 444 444 444
152 126 126 169 IIL BBB 333 333 333 111 111 322 444 444 444
153 127 127 170 VVV BBB 333 333 333 111 111 444 444 444 444
154 128 128 171 VVV AAA 222 333 111 111 111 444 444 444 444
155 129 129 172 GGG PPP 111 111 333 111 444 444 444 444 444
156 130 130 173 NNN PPP 222 111 333 222 111 121 444 444 444
157 131 131 174 PPP PPP 333 111 222 111 321 212 121 444 444
158 132 132 175 AAC AAA 222 111 111 111 441 444 444 444 444
159 133 133 176 NNN AAA 222 111 111 111 111 222 444 444 444
160 134 134 177 TTT AAA 222 111 111 111 111 444 444 444 444
161 135 135 178 NNN AAA 222 111 111 111 111 121 444 444 444
162 136 136 179 CCA AAA 222 111 111 111 224 444 444 444 444
163 137 137 180 LLL AAA 222 111 111 111 222 222 444 444 444
164 138 138 181 TTI AAA 222 111 111 111 111 441 444 444 444
165 139 139 182 AAC AAA 222 111 111 111 442 444 444 444 444
166 140 140 183 SSL AAA 222 111 111 111 113 443 444 444 444
167 141 141 184 KKK AAA 222 111 111 111 211 112 111 331 444
168 142 142 185 SSN AAA 222 133 222 111 221 441 444 444 444
169 143 143 186 AAA BBB 333 333 222 111 444 444 444 444 444
170 144 144 187 PPP AAA 222 111 111 111 322 111 222 444 444
171 145 145 188 SSD AAA 222 111 122 111 111 441 444 444 444
172 146 146 189 III PBB 333 333 333 111 111 111 444 444 444
173 147 147 190 PPP PPP 333 111 222 111 311 222 211 444 444
174 148 148 191 KKA AAA 222 111 111 111 314 114 114 214 444
175 149 149 192 EEK AAA 222 111 111 111 312 131 111 442 444
176 150 150 193 NNN AAA 222 111 112 111 111 121 444 444 444
177 151 151 194 FFF BBB 333 333 333 111 111 222 444 444 444
178 152 152 195 SSH BBB 333 333 333 111 111 441 444 444 444
179 153 153 196 CCA BBB 333 333 333 111 334 444 444 444 444
180 154 154 197 LLL BBP 333 111 333 111 221 221 444 444 444
181 155 155 198 TTT AAA 222 333 222 111 222 444 444 444 444
182 156 156 199 RRR AAA 222 111 111 111 222 333 111 222 444
183 157 157 200 LLL AAA 222 111 111 111 222 222 444 444 444
184 158 158 201 DDD AAA 222 111 111 111 111 111 444 444 444
185 159 159 202 HHE AAA 222 111 111 111 222 221 441 444 444
186 160 160 203 NNN AAA 222 111 111 111 111 111 444 444 444
187 161 161 204 RRR AAA 222 111 111 111 111 111 111 111 444
188 162 162 205 AAA AAA 222 111 111 111 444 444 444 444 444
189 163 163 206 KKK AAA 222 111 111 111 111 111 133 111 444
190 164 164 207 AAC AAA 222 111 111 111 442 444 444 444 444
191 165 165 208 QQQ AAA 222 111 111 111 111 222 112 444 444
192 166 166 209 IIL AAA 222 111 111 111 111 121 444 444 444
193 167 167 210 AAA AAA 222 111 111 111 444 444 444 444 444
194 168 168 211 LLL AAA 222 111 111 111 112 112 444 444 444
195 169 169 212 KKK AAA 222 111 111 111 222 333 111 111 444
196 170 170 213 LLA AAA 333 313 122 111 114 114 444 444 444
197 171 171 214 GGG LLL 332 222 222 111 444 444 444 444 444
198 172 172 215 VVV PPB 333 333 333 111 231 444 444 444 444
199 173 173 216 TTF BPP 333 311 333 111 212 442 444 444 444
200 174 174 217 SSY AAA 222 111 111 111 213 442 444 444 444
201 175 175 218 DDD AAA 222 113 112 111 113 211 444 444 444
202 176 176 219 DDK AAA 222 113 112 111 111 211 443 441 444
203 177 177 220 VVV BPB 333 333 333 111 111 444 444 444 444
204 178 178 221 KKS BBB 222 333 333 111 231 134 214 134 444
205 179 179 222 NNN LLL 333 222 222 111 111 122 444 444 444
206 180 180 223 VVV PPB 333 113 333 111 121 444 444 444 444
207 181 181 224 IIT BBB 333 333 333 111 111 114 444 444 444
208 182 182 225 III BBB 333 333 333 111 111 322 444 444 444
209 183 183 226 WWW BBP 111 333 333 111 111 111 444 444 444
210 184 184 227 GGG EEE 222 222 333 111 444 444 444 444 444
211 185 185 228 NNN PPP 333 113 333 111 222 111 444 444 444
212 186 186 229 HHH BBB 222 111 223 111 222 221 444 444 444
213 187 187 230 SSS BBB 111 333 333 111 211 444 444 444 444
214 188 188 231 SST AAA 222 111 122 111 112 444 444 444 444
215 189 189 232 TTT AAA 233 333 221 111 222 444 444 444 444
216 190 190 233 QQQ PPP 333 111 333 111 333 111 111 444 444
217 191 191 234 YYV BBB 333 333 333 111 221 124 444 444 444
218 192 192 235 PPP BBP 333 111 222 111 331 222 111 444 444
219 193 193 236 DDD BBB 333 331 333 111 222 111 444 444 444
220 194 194 237 VVF AAA 222 333 221 111 223 442 444 444 444
221 195 195 238 NNL AAA 222 111 111 111 112 221 444 444 444
222 196 196 239 HHN AAA 232 333 222 111 111 121 444 444 444
223 197 197 240 AAA PBP 333 131 333 111 444 444 444 444 444
224 198 198 241 KKK BBB 333 333 333 111 111 221 311 131 444
225 199 199 242 VVI BBB 331 333 333 111 321 441 444 444 444
226 200 200 243 KKD BBL 331 332 332 111 212 121 314 134 444
227 201 201 ---- LL- BP- 33- 33- 33- 11- 11- 11- 44- 44- 44-
228 202 202 ---- QQ- AA- 22- 11- 11- 11- 11- 22- 11- 44- 44-
229 203 203 ---- AA- AA- 11- 33- 11- 11- 44- 44- 44- 44- 44-
230 204 204 ---- KK- BB- 11- 33- 33- 11- 32- 11- 12- 12- 44-
231 205 205 244 EEG BBL 332 112 332 111 224 114 114 444 444
232 206 206 245 VVR BBB 133 333 333 111 321 441 442 441 444
233 207 207 246 GGP PPP 333 111 332 111 441 442 441 444 444
234 208 208 247 VVV AAA 222 111 111 111 113 444 444 444 444
235 209 209 248 YYK AAA 222 111 111 111 111 121 443 443 444
236 210 210 249 EEE AAA 222 113 111 111 221 111 111 444 444
237 211 211 250 AAV AAA 222 113 111 111 441 444 444 444 444
238 212 212 251 VVI AAB 333 111 113 111 111 441 444 444 444
239 213 213 252 KKK LLA 222 223 221 111 111 123 111 322 444
240 214 214 253 DDR BBB 333 331 233 111 222 111 441 441 444
241 215 215 254 DDT AAA 222 111 111 111 111 114 444 444 444
242 216 216 255 SSK AAA 222 111 111 111 321 442 441 441 444
243 217 217 256 WWW AAA 222 111 111 111 222 111 444 444 444
244 218 218 257 LLL AAA 222 111 111 111 111 111 444 444 444
245 219 219 258 KKE AAA 222 331 121 111 111 111 211 214 444
246 220 220 259 GGE AAA 222 333 331 111 441 442 441 444 444
247 221 221 260 EEE AAA 222 111 111 111 221 121 111 444 444
248 222 222 261 FFF AAA 222 111 111 111 222 122 444 444 444
249 223 223 262 IIT AAA 222 111 111 111 113 124 444 444 444
250 224 224 263 TTI AAA 222 111 111 111 111 441 444 444 444
251 225 225 264 TTT AAA 222 111 111 111 112 444 444 444 444
252 226 226 265 VVV AAA 222 111 111 111 111 444 444 444 444
253 227 227 266 QQQ AAA 222 111 111 111 312 111 112 444 444
254 228 228 267 QQK AAA 222 333 212 111 111 222 112 441 444
255 229 229 268 RRR AAA 222 111 111 111 222 333 111 111 444
256 230 230 269 GGG AAA 222 111 111 111 444 444 444 444 444
257 231 231 ---- AA- AA- 22- 11- 11- 11- 44- 44- 44- 44- 44-
258 232 232 270 AAG AAA 222 111 111 111 444 444 444 444 444
259 ---- ---- 271 --A --A --2 --1 --1 --1 --4 --4 --4 --4 --4
260 233 233 272 VVL AAA 222 111 111 111 111 441 444 444 444
261 234 234 273 III AAA 222 111 111 111 111 112 444 444 444
262 235 235 ---- KK- AA- 22- 11- 11- 11- 22- 12- 21- 13- 44-
263 236 236 274 AAQ AAA 222 111 111 111 443 443 441 444 444
264 ---- ---- 275 --K --A --2 --3 --1 --1 --1 --2 --1 --3 --4
265 ---- ---- 276 --W --A --3 --1 --1 --1 --2 --2 --4 --4 --4
266 237 237 277 RRG AAL 332 112 111 111 114 114 224 314 444
267 238 238 ---- KK- LL- 22- 22- 22- 11- 11- 23- 31- 11- 44-
268 239 239 278 LLR BBB 331 333 333 111 112 211 442 441 444
269 240 240 279 SSS PPP 113 311 333 111 113 444 444 444 444
270 241 241 280 SSS PPA 333 113 332 111 211 444 444 444 444
271 242 242 281 AAA AAA 222 331 111 111 444 444 444 444 444
272 243 243 282 MMA AAA 222 111 111 111 224 114 124 444 444
273 244 244 283 SSS AAA 222 111 111 111 111 444 444 444 444
274 245 245 284 AAT AAA 222 111 111 111 442 444 444 444 444
275 246 246 285 AAA AAA 222 111 111 111 444 444 444 444 444
276 247 247 286 KKV AAA 222 111 111 111 221 324 114 314 444
277 248 248 287 AAS AAA 222 111 111 111 441 444 444 444 444
278 249 249 288 III AAA 222 111 111 111 111 111 444 444 444
279 250 250 289 CCA AAA 222 111 111 111 114 444 444 444 444
280 251 251 290 DDD AAA 222 111 111 111 111 111 444 444 444
281 252 252 291 HHA AAA 222 111 111 111 224 124 444 444 444
282 253 253 292 VVI AAA 222 111 111 111 111 441 444 444 444
283 254 254 293 RRK AAA 222 111 111 111 221 111 122 131 444
284 255 255 294 DDS AAA 222 111 111 111 112 214 444 444 444
285 256 256 295 IIL AAA 222 113 111 111 111 111 444 444 444
286 257 257 296 WWV AAA 222 113 112 111 222 224 444 444 444
287 258 258 297 FFT AAB 333 333 213 111 111 114 444 444 444
288 259 259 298 GGP EEP 113 221 332 111 441 442 441 444 444
289 260 260 299 TTT PPP 333 131 333 111 221 444 444 444 444
290 261 261 300 PPP PPP 111 111 222 111 331 222 111 444 444
291 262 262 301 EEE PPP 222 111 333 111 231 112 211 444 444
292 263 263 302 GGG LLL 222 222 222 111 444 444 444 444 444
293 264 264 303 EED BBP 333 333 333 111 122 211 114 444 444
294 265 265 304 FFW BBB 333 333 333 111 333 221 444 444 444
295 266 266 305 VVF BBB 333 333 333 111 223 442 444 444 444
296 267 267 306 SSS BBP 333 311 333 111 222 444 444 444 444
297 268 268 307 MMT BBB 333 333 333 111 223 114 334 444 444
298 269 269 308 GGG BBB 333 111 333 111 444 444 444 444 444
299 270 270 309 IIV BBB 111 333 333 111 222 114 444 444 444
300 271 271 310 IIY PPP 333 111 333 111 332 332 444 444 444
301 272 272 311 SST AAA 332 133 122 111 212 444 444 444 444
302 273 273 312 DDT LPA 222 111 331 111 111 114 444 444 444
303 274 274 313 GGG LLA 333 221 222 111 444 444 444 444 444
304 275 275 314 NNN PPP 333 111 333 111 133 122 444 444 444
305 276 276 315 SSP AAA 222 331 221 111 123 442 441 444 444
306 277 277 316 YYY AAA 333 331 222 111 111 111 444 444 444
307 278 278 317 GGG LLL 333 222 222 111 444 444 444 444 444
308 279 279 318 VVI BBP 331 333 333 111 113 442 444 444 444
309 280 280 319 PPA PPP 333 111 223 111 314 224 214 444 444
310 281 281 320 DDE PPP 222 113 333 111 111 111 441 444 444
311 282 282 321 DDD LLL 322 222 222 111 222 211 444 444 444
312 283 283 322 LLI BBB 333 333 333 111 112 111 444 444 444
313 284 284 323 LLV BBB 333 333 333 111 221 114 444 444 444
314 285 285 324 YYF BBB 333 333 333 111 222 111 444 444 444
315 286 286 325 SSS PBB 333 111 333 111 333 444 444 444 444
316 287 287 326 FFM BBB 131 333 333 111 111 211 441 444 444
317 288 288 327 PPP PPP 333 111 222 111 322 111 222 444 444
318 289 289 328 VVC BBB 333 333 333 111 121 444 444 444 444
319 290 290 329 TTR BBB 333 333 333 111 123 441 441 442 444
320 291 291 330 IIS BBB 333 333 333 111 113 114 444 444 444
321 292 292 331 KKK BBA 123 333 332 111 221 211 131 311 444
322 ---- ---- 332 --G --L --2 --2 --2 --1 --4 --4 --4 --4 --4
323 293 293 333 DDD LLA 113 223 222 111 113 111 444 444 444
324 294 294 334 KKG LLL 222 222 222 111 114 114 114 114 444
325 295 295 335 TTD BBP 333 333 333 111 112 441 444 444 444
326 296 296 336 WWY PPB 333 333 333 111 333 221 444 444 444
327 297 297 337 KKE BBB 333 333 333 111 223 111 231 124 444
328 298 298 338 IIL PPP 333 111 333 111 111 113 444 444 444
329 299 299 339 VVA PPB 333 113 333 111 114 444 444 444 444
330 300 300 340 EET BBA 222 333 331 111 112 114 214 444 444
331 ---- ---- 341 --D --A --2 --1 --2 --1 --3 --1 --4 --4 --4
332 301 301 ---- GG- LL- 33- 22- 22- 11- 44- 44- 44- 44- 44-
333 302 302 342 LLV BPB 333 113 333 111 111 114 444 444 444
334 303 303 343 PPS PPB 333 113 223 111 322 114 224 444 444
335 304 304 344 IIN BBB 333 333 333 111 112 321 444 444 444
336 305 305 345 NND PPB 333 113 333 111 133 121 444 444 444
337 306 306 346 DDD AAA 222 111 111 111 111 111 444 444 444
338 307 307 347 FFF AAA 222 111 111 111 222 112 444 444 444
339 308 308 348 SSL AAA 222 111 111 111 222 442 444 444 444
340 309 309 349 RRW AAA 222 111 111 111 122 132 124 114 444
341 310 310 350 EEE APA 222 111 131 111 221 222 111 444 444
342 311 311 351 KKR ALA 222 121 111 111 111 121 111 123 444
343 312 312 352 MMI AAA 222 111 111 111 111 111 234 444 444
344 313 313 353 DDK AAA 222 111 111 111 111 112 442 441 444
345 314 314 354 LLK AAA 222 111 111 111 211 211 441 443 444
346 315 315 355 TTS AAA 222 111 111 111 313 444 444 444 444
347 316 316 356 AAE AAA 222 111 111 111 442 441 441 444 444
348 317 317 357 KKA AAA 222 311 111 111 224 114 114 214 444
349 318 318 358 EEE AAA 222 111 111 111 222 111 111 444 444
350 319 319 359 LLL AAA 222 111 111 111 111 111 444 444 444
351 320 320 360 AAL AAA 222 111 111 111 441 442 444 444 444
352 321 321 361 EEA AAA 222 111 111 111 114 114 114 444 444
353 322 322 362 EEE AAA 222 111 111 111 111 111 111 444 444
354 323 323 363 KKK AAA 222 111 111 111 222 111 111 111 444
355 324 324 364 EEK AAA 222 111 111 111 111 111 111 441 444
356 325 325 365 TTC AAA 222 111 111 111 112 444 444 444 444
357 326 326 366 AAV AAA 223 113 112 111 442 444 444 444 444
358 327 327 367 FFA AAA 222 111 211 111 114 114 444 444 444
359 328 328 ---- EE- AA- 22- 31- 11- 11- 22- 11- 21- 44- 44-
360 329 329 ---- FF- AA- 22- 11- 11- 11- 22- 12- 44- 44- 44-
361 330 330 ---- LL- AA- 22- 11- 11- 11- 11- 12- 44- 44- 44-
362 331 331 368 SSH AAA 222 331 211 111 213 443 444 444 444
363 332 332 ---- SS- PA- 44- 31- 31- 11- 32- 44- 44- 44- 44-
364 333 333 ---- AA- UU- 44- 32- 44- 44- 44- 44- 44- 44- 44-
365 ---- ---- 369 --L --A --2 --3 --1 --1 --1 --1 --4 --4 --4
366 ---- ---- 370 --T --A --3 --3 --1 --1 --2 --4 --4 --4 --4
367 ---- ---- 371 --G --L --3 --2 --2 --1 --4 --4 --4 --4 --4
368 ---- ---- 372 --E --A --3 --3 --2 --1 --1 --3 --1 --4 --4
369 ---- ---- 373 --G --E --2 --2 --3 --1 --4 --4 --4 --4 --4
370 ---- ---- 374 --N --P --3 --3 --3 --1 --1 --2 --4 --4 --4
371 ---- ---- 375 --A --B --3 --3 --3 --1 --4 --4 --4 --4 --4
372 ---- ---- 376 --Y --B --3 --3 --3 --1 --2 --2 --4 --4 --4
373 ---- ---- 377 --C --B --3 --3 --3 --1 --1 --4 --4 --4 --4
374 ---- ---- 378 --D --A --3 --3 --2 --1 --2 --1 --4 --4 --4
375 ---- ---- 379 --V --B --3 --3 --3 --1 --2 --4 --4 --4 --4
376 ---- ---- 380 --P --P --3 --1 --2 --1 --2 --1 --2 --4 --4
377 ---- ---- 381 --E --A --2 --1 --1 --1 --1 --2 --1 --4 --4
378 ---- ---- 382 --D --B --2 --1 --3 --1 --1 --1 --4 --4 --4
379 ---- ---- 383 --T --A --3 --3 --1 --1 --3 --4 --4 --4 --4
380 ---- ---- 384 --M --P --4 --1 --3 --1 --2 --3 --2 --4 --4
381 ---- ---- 385 --L --U --4 --1 --4 --4 --1 --1 --4 --4 --4
Sequence identity comparison (ID_TABLE):
Diagonal ... number of residues;
Upper triangle ... number of identical residues;
Lower triangle ... % sequence identity, id/min(length).
1bmdA @14mdhA @25mdhA @27mdhA @2
1bmdA @1 327 168 168 159
4mdhA @2 51 333 328 137
5mdhA @2 51 98 333 137
7mdhA @2 49 41 41 351
Weighted pair-group average clustering based on a distance matrix:
.---------------------------------------------------- 1bmdA @1.9 49.0000
|
| .--- 4mdhA @2.5 2.0000
| |
.---------------------------------------------------------- 5mdhA @2.4 55.0000
|
.------------------------------------------------------------ 7mdhA @2.4
+----+----+----+----+----+----+----+----+----+----+----+----+
57.1200 47.5800 38.0400 28.5000 18.9600 9.4200 -0.1200
52.3500 42.8100 33.2700 23.7300 14.1900 4.6500
Dynamically allocated memory at finish [B,kB,MB]: 12795061 12495.177 12.202
Starting time : 2004/09/15 17:57:44.418
Closing time : 2004/09/15 17:57:51.075
Total CPU time [seconds] : 6.61