|directories| |pdb_dir|./| |fasta_dir|./| |gmm_dir|./| |topology_dictionary| |molecule_name|color|fasta_fn|fasta_id|pdb_fn|chain|residue_range|pdb_offset|bead_size|em_residues_per_gaussian|rigid_body | super_rigid_body | chain_of_super_rigid_bodies | |PSD-95|blue| 2xkx.fasta.txt|2XKX:A| 2xkx.pdb|A| 62,148|0|300|0|1|1|| |PSD-95|blue| 2xkx.fasta.txt|2XKX:A| BEADS |A| 149,156|0| 10|0|0|1|| |PSD-95|blue| 2xkx.fasta.txt|2XKX:A| 2xkx.pdb|A| 157,243|0|300|0|2|1|| |PSD-95|blue| 2xkx.fasta.txt|2XKX:A| BEADS |A| 244,309|0| 10|0|0|1|| |PSD-95|blue| 2xkx.fasta.txt|2XKX:A| 2xkx.pdb|A| 310,390|0|300|0|3|1|| |PSD-95|blue| 2xkx.fasta.txt|2XKX:A| BEADS |A| 391,424|0| 10|0|0|1|| |PSD-95|blue| 2xkx.fasta.txt|2XKX:A| 2xkx.pdb|A| 425,495|0|300|0|4|1|| |PSD-95|blue| 2xkx.fasta.txt|2XKX:A| BEADS |A| 496,530|0| 10|0|0|1|| |PSD-95|blue| 2xkx.fasta.txt|2XKX:A| 2xkx.pdb|A| 531,590|0|300|0|5|1|| |Kir2.1-I|red| 2xky.fasta.txt|2XKY:I| 2xky.pdb|I| 69,309|0|300|0|6|2|| |Kir2.1-J|red| 2xky.fasta.txt|2XKY:J| 2xky.pdb|J| 69,309|0|300|0|7|2|| |Kir2.1-K|red| 2xky.fasta.txt|2XKY:K| 2xky.pdb|K| 69,309|0|300|0|8|2|| |Kir2.1-L|red| 2xky.fasta.txt|2XKY:L| 2xky.pdb|L| 69,309|0|300|0|9|2|| |Kir2.1-2-I|green| 2xky.fasta.txt|2XKY:I| 2xky_2_6.pdb|I| 69,309|0|300|0|10|3|| |Kir2.1-2-J|green| 2xky.fasta.txt|2XKY:J| 2xky_2_6.pdb|J| 69,309|0|300|0|11|3|| |Kir2.1-2-K|green| 2xky.fasta.txt|2XKY:K| 2xky_2_6.pdb|K| 69,309|0|300|0|12|3|| |Kir2.1-2-L|green| 2xky.fasta.txt|2XKY:L| 2xky_2_6.pdb|L| 69,309|0|300|0|13|3||