Hi <br>
I have modeller8.1 on a windows machine. I try to use the
model-segment.py script&nbsp; but modeller send me always the same
error:<br>
forrtl: severe (64): input conversion error, unit -5, file Internal Fo<br>
ad<br>
Image&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
PC&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Routine&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Line&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Source<br>
libifcoremd.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0025DD7A&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
libifcoremd.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0025B010&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
libifcoremd.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp; 002261B8&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
libifcoremd.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp; 00226670&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
libifcoremd.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0027F5F9&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
mod8v1.exe&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
00494996&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
mod8v1.exe&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
00491E53&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
mod8v1.exe&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
00474A41&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
mod8v1.exe&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
0042D906&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
mod8v1.exe&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
00422ED8&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26D0A705&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26C99DA7&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26CAF9E6&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26CAC424&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26CADAAE&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26CE8CF0&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26C99DA7&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26CAF9E6&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26CAC424&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26CADAAE&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26CAF4A9&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26CAF1F9&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26CAC250&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26CAF3FD&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26CAF1F9&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26CAC250&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26CAF3FD&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26CAF1F9&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26CAC250&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26CADAAE&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26CAF4A9&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26CAF1F9&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26CAC250&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26CADAAE&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26CA8922&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26D22BD4&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26D22B86&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26D22B50&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26D21B2E&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26D21569&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
python23.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 26D214B4&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
mod8v1.exe&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
004086BC&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
mod8v1.exe&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
00401347&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
mod8v1.exe&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
005E8C41&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
mod8v1.exe&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
005E679B&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
kernel32.dll&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 7C816D4F&nbsp;
Unknown&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
Unknown&nbsp; Unknown<br>
_____________________________________________________________<br>
&nbsp;my script is:<br>
<br>
from modeller.automodel import *&nbsp;&nbsp;&nbsp; # Load the automodel class<br>
<br>
log.verbose()<br>
<br>
# Override the 'select_atoms' routine in the 'automodel' class<br>
class mymodel(automodel):<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; def select_atoms(self):<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
self.pick_atoms(selection_segment=('923:','924:','925:','926:','927:','928:','929:','930:','931:','932:','933:','934:','935:','936:','937:','938:','939:','940:','941:','942:','943:','944:','945:','946:','947:','948:','949:','950:','951:','952:','953:','954:','955:','956:','957:','958:','959:','960:','961:','962:','963:','964:','965:','966:','967:','968:','969:','970:','971:','972:','973:','974:','975:','976:','977:','978:','979:','980:','981:','982:','983:','984:','985:','986:','987:','988:','989:','990:'),
<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
selection_search='segment', pick_atoms_set=1,<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
res_types='all', atom_types='all',<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
selection_from='all', selection_status='initialize')<br>
<br>
env = environ()<br>
# directories for input atom files<br>
env.io.atom_files_directory = 'C:\master'<br>
# selected atoms do not feel the neighborhood<br>
env.edat.nonbonded_sel_atoms = 2<br>
<br>
a = mymodel(env,<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
alnfile&nbsp; = 'fosfalcapirstrano1daq.ali',&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; #
alignment filename<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
knowns&nbsp;&nbsp; =
'1DAQB',&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
# codes of the templates<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
sequence =
'14521248')&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
# code of the target<br>
<br>
a.starting_model=
3&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
# index of the first model <br>
a.ending_model&nbsp; =
3&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
# index of the last model<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
# (determines how many models to calculate)<br>
a.make()&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
# do homology modelling<br>
-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------<br>
my alignment file is :<br>
&gt;P1;1K7H<br>
structure:1K7H :1&nbsp; :A :&nbsp; :B :unknown:unknown:-1:-1<br>
---------------EEDKAYWNKDAQDALDKQLGI---KLREKQAKNVIFFLGDGMSLSTVTAARIYKGGLTGK<br>
-FEREKI-SWEEFDFAALSKTYNTD------KQVTDSAASATAYLTGVKTNQGVIGLDANTVRTNCSYQLDESLF<br>
TYSIAHWFQEAGRSTGVVTSTRVTHATPAGTYAHVADRDWENDSDVVHDRE--DPE-I--CDDIAEQLVFREPGK<br>
NFKVIMGGGRRGFFPEEALDIEDG----IPGERED-----GKHLITDWLDDKASQGATASYVWNRDDLLAV-DIA<br>
NTD----YLMGLFSYTHLDTVL---------------------TRDAEMDPTLPEMTKVAIEMLTKDENGFFLLV<br>
EGGRIDHMHHANQIRQSLAETLDMEEAVSMALSMT-DPEETIILVTADHGHTLTITGYA------------DRNT<br>
DILDFAGISDLDDRRYTILDYGSGPGYHITEDGKRYEPTEEDLKDINFRYASAAPKHSATHDGTDVGIWVNGPFA<br>
HLFTGVYEENYIPHALAYAACVGTGRTFCD---------------------------------------------<br>
------------------------/---------------EEDKAYWNKDAQDALDKQLGI---KLREKQAKNVI<br>
FFLGDGMSLSTVTAARIYKGGLTGK-FEREKI-SWEEFDFAALSKTYNTD------KQVTDSAASATAYLTGVKT<br>
NQGVIGLDANTVRTNCSYQLDESLFTYSIAHWFQEAGRSTGVVTSTRVTHATPAGTYAHVADRDWENDSDVVHDR<br>
E--DPE-I--CDDIAEQLVFREPGKNFKVIMGGGRRGFFPEEALDIEDG----IPGERED-----GKHLITDWLD<br>
DKASQGATASYVWNRDDLLAV-DIANTD----YLMGLFSYTHLDTVL---------------------TRDAEMD<br>
PTLPEMTKVAIEMLTKDENGFFLLVEGGRIDHMHHANQIRQSLAETLDMEEAVSMALSMT-DPEETIILVTADHG<br>
HTLTITGYA------------DRNTDILDFAGISDLDDRRYTILDYGSGPGYHITEDGKRYEPTEEDLKDINFRY<br>
ASAAPKHSATHDGTDVGIWVNGPFAHLFTGVYEENYIPHALAYAACVGTGRTFCD*<br>
&gt;P1;1EW2<br>
structure:1EW2 :1&nbsp; :A :&nbsp; :B :unknown:unknown:-1:-1<br>
----------IIPVEEENPDFWNREAAEALGAAKKL---QPAQTAAKNLIIFLGDGMGVSTVTAARILKGQKKDK<br>
LGPEIPL-AMDRFPYVALSKTYNVD------KHVPDSGATATAYLCGVKGNFQTIGLSAAARFNQCNTTR--GNE<br>
VISVMNRAKKAGKSVGVVTTTRVQHASPAGTYAHTVNRNWYSDADVP--AS--ARQEG--CQDIATQLISNM---<br>
DIDVILGGGRKYMFRMGTPDPEYPDDYSQGGTRLD-----GKNLVQEWLAKR----QGARYVWNRTELMQASLDP<br>
SVT----HLMGLFEPGDMKYEI---------------------HRDSTLDPSLMEMTEAALRLLSRNPRGFFLFV<br>
EGGRIDHGHHESRAYRALTETIMFDDAIERAGQLT-SEEDTLSLVTADHSHVFSFGGYP------------LRGS<br>
SIFGLAPGKARDRKAYTVLLYGNGPGYVLK-DGARPDVTESESGSPEYRQQSAVPLDEETHAGEDVAVFARGPQA<br>
HLVHGVQEQTFIAHVMAFAACLEPYTACDLAPP------------------------------------------<br>
-------------------------/----------IIPVEEENPDFWNREAAEALGAAKKL---QPAQTAAKNL<br>
IIFLGDGMGVSTVTAARILKGQKKDKLGPEIPL-AMDRFPYVALSKTYNVD------KHVPDSGATATAYLCGVK<br>
GNFQTIGLSAAARFNQCNTTR--GNEVISVMNRAKKAGKSVGVVTTTRVQHASPAGTYAHTVNRNWYSDADVP--<br>
AS--ARQEG--CQDIATQLISNM---DIDVILGGGRKYMFRMGTPDPEYPDDYSQGGTRLD-----GKNLVQEWL<br>
AKR----QGARYVWNRTELMQASLDPSVT----HLMGLFEPGDMKYEI---------------------HRDSTL<br>
DPSLMEMTEAALRLLSRNPRGFFLFVEGGRIDHGHHESRAYRALTETIMFDDAIERAGQLT-SEEDTLSLVTADH<br>
SHVFSFGGYP------------LRGSSIFGLAPGKARDRKAYTVLLYGNGPGYVLK-DGARPDVTESESGSPEYR<br>
QQSAVPLDEETHAGEDVAVFARGPQAHLVHGVQEQTFIAHVMAFAACLEPYTACDLAPP*<br>
&gt;P1;1ED9<br>
structure:1ED9 :1&nbsp; :A :&nbsp; :B :unknown:unknown:-1:-1<br>
TPEMPVLENRAAQGDITAPGGA--RRLTGD--QTAALRDSLSDKPAKNIILLIGDGMGDSEITAARNYAE-----<br>
-GAGGFFKGIDALPLTGQYTHYALNKKTGKPDYVTDSAASATAWSTGVKTYNGALGVDIHE------------KD<br>
HPTILEMAKAAGLATGNVSTAELQDATPAALVAHVTSRKCYGPSATSEKCPGNALE-KGGKGSITEQLLN----A<br>
RADVTLGGGAKTFA-----------------ETATAGEWQGKTLREQAQARG------YQLVSDAASLNSV-T--<br>
-EANQQKPLLGLFADGNMPVRWLGPKATYHGNIDKPAVTCTPNPQRNDSVPTLAQMTDKAIELLSKNEKGFFLQV<br>
EGASIDKQDHAANPCGQIGETVDLDEAVQRALEFAKKEGNTLVIVTADHAHASQIVAPDTKAPGLTQALNTKDGA<br>
VM---------------VMSYGN------------------------------SEEDSQEHTGSQLRIAAYGPHA<br>
ANVVGLTDQTDLFYTMKAALGLK----------------------------------------------------<br>
------------------------/TPEMPVLENRAAQGDITAPGGA--RRLTGD--QTAALRDSLSDKPAKNII<br>
LLIGDGMGDSEITAARNYAE------GAGGFFKGIDALPLTGQYTHYALNKKTGKPDYVTDSAASATAWSTGVKT<br>
YNGALGVDIHE------------KDHPTILEMAKAAGLATGNVSTAELQDATPAALVAHVTSRKCYGPSATSEKC<br>
PGNALE-KGGKGSITEQLLN----ARADVTLGGGAKTFA-----------------ETATAGEWQGKTLREQAQA<br>
RG------YQLVSDAASLNSV-T---EANQQKPLLGLFADGNMPVRWLGPKATYHGNIDKPAVTCTPNPQRNDSV<br>
PTLAQMTDKAIELLSKNEKGFFLQVEGASIDKQDHAANPCGQIGETVDLDEAVQRALEFAKKEGNTLVIVTADHA<br>
HASQIVAPDTKAPGLTQALNTKDGAVM---------------VMSYGN---------------------------<br>
---SEEDSQEHTGSQLRIAAYGPHAANVVGLTDQTDLFYTMKAALGLK*<br>
&gt;P1;1DAQA<br>
structure:1DAQA :1&nbsp; :A :57&nbsp; : :unknown:unknown:-1:-1<br>
---------------------------------------------------------------------------<br>
---------------------------------------------------------------------------<br>
---------------------------------------------------------------------------<br>
---------------------------------------------------------------------------<br>
---------------------------------------------------------------------------<br>
---------------------------------------------------------------------------<br>
---------------------------------------------------------------------------<br>
----------------------------------------MSTKLYGDVNDDGKVNSTDAVALKRYVLRSGISIN<br>
TDN-ADLNEDGRVNSTDLGILKRYILKEIDTLPYKNG--------------------------------------<br>
---------------------------------------------------------------------------<br>
---------------------------------------------------------------------------<br>
---------------------------------------------------------------------------<br>
---------------------------------------------------------------------------<br>
---------------------------------------------------------------------------<br>
---------------------------------------------------------------------------<br>
---------------------------------------------------------------------------<br>
--------------------------------------------------*<br>
&gt;P1;1DAQB<br>
structure:1DAQB :1&nbsp; :A :57&nbsp; : :unknown:unknown:-1:-1<br>
---------------------------------------------------------------------------<br>
---------------------------------------------------------------------------<br>
---------------------------------------------------------------------------<br>
---------------------------------------------------------------------------<br>
---------------------------------------------------------------------------<br>
---------------------------------------------------------------------------<br>
---------------------------------------------------------------------------<br>
---------------------------------------------------------------------------<br>
------------------------/---------------------------------------------------<br>
---------------------------------------------------------------------------<br>
---------------------------------------------------------------------------<br>
---------------------------------------------------------------------------<br>
---------------------------------------------------------------------------<br>
---------------------------------------------------------------------------<br>
---------------------------------------------------------------------------<br>
----------------------------------------------------------------MSTKLYGDVND<br>
DGKVNSTDAVALKRYVLRSGISINTDN-ADLNEDGRVNSTDLGILKRYILKEIDTLPYKNG*<br>
&gt;P1;14521248<br>
sequence:14521248:1&nbsp; :A :&nbsp; :B :unknown:unknown:-1:-1<br>
----------------MMKMKLARFLLIFIIFSSMFPFANASPSGVRNVIILIGDGMGFSQLQLTKLVYGHLNME<br>
DFPYTGIELTDSLS-----------------GEVTDSAAAGTAIATGVKTYNRMISTTNVTGKL---------VN<br>
LTTLLEIAQMLGKATGLVTTTRITHATPAVFASHVPDRDMEEEIARQLILHNVT---------------------<br>
---VLMGGGREKFSEEVLKLAEDYGY---------------------------------SIVYTREDLEKVKDG-<br>
-------KVLGLFAEGHLPYVL----------------------DRSEEDVSLLEMTKKAIEILEKNPNGFFLMI<br>
EGGRIDHACHANDVASIVAETKEFDDVVGYVLDYARRRGDTLVIVLADHETGGLGIGLNYGHSVDIDSIRRIDAS<br>
IEEMSKEIKSGGDIRDVIRRHTGLELTDEEVKEIEEAKNSTNKYALGNIIGEIISKKLGVGFVSHKHTGEPVPLL<br>
AYGPGAENFVGFKHHVDTAKVIAKLMIFGDRSISFTIKGVSKIKGDVTGDYRVDERDAYATLMLLLGDLVDTELE<br>
NIADMDNNGIIDLLDVMAILQASS/-----------------MMKMKLARFLLIFIIFSSMFPFANASPSGVRNV<br>
IILIGDGMGFSQLQLTKLVYGHLNMEDFPYTGIELTDSLS-----------------GEVTDSAAAGTAIATGVK<br>
TYNRMISTTNVTGKL---------VNLTTLLEIAQMLGKATGLVTTTRITHATPAVFASHVPDRDMEEEIARQLI<br>
LHNVT------------------------VLMGGGREKFSEEVLKLAEDYGY-----------------------<br>
----------SIVYTREDLEKVKDG--------KVLGLFAEGHLPYVL----------------------DRSEE<br>
DVSLLEMTKKAIEILEKNPNGFFLMIEGGRIDHACHANDVASIVAETKEFDDVVGYVLDYARRRGDTLVIVLADH<br>
ETGGLGIGLNYGHSVDIDSIRRIDASIEEMSKEIKSGGDIRDVIRRHTGLELTDEEVKEIEEAKNSTNKYALGNI<br>
IGEIISKKLGVGFVSHKHTGEPVPLLAYGPGAENFVGFKHHVDTAKVIAKLMIFGDRSISFTIKGVSKIKGDVTG<br>
DYRVDERDAYATLMLLLGDLVDTELENIADMDNNGIIDLLDVMAILQASS*<br>
_________________________________________________________________________________________<br>
<br>
<br>
someone can help my?<br>
thank's in advance<br>
<br>
<br>